| 猪流行性腹泻病毒贵州流行株N基因的克隆、测序与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 韦秒粘,陈兰,张蓉,陈泽,赵学武,何广霞,周碧君,王开功,单春兰,朱二鹏,程振涛.猪流行性腹泻病毒贵州流行株N基因的克隆、测序与生物信息学分析[J].黑龙江畜牧兽医,2024(7):23-29. |
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| 作者姓名： | 韦秒粘 陈兰 张蓉 陈泽 赵学武 何广霞 周碧君 王开功 单春兰 朱二鹏 程振涛 |
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| 作者单位： | 1. 贵州大学动物科学学院;2. 兴义市威舍镇畜牧兽医站;3. 贵州省动物疫病与兽医公共卫生重点实验室 |
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| 基金项目： | 贵州省优秀青年科技人才项目(黔科合平台人才[2021]5646)； |
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| 摘 要： | 为了了解贵州省猪流行性腹泻(porcine epidemic diarrhea, PED)的流行情况，试验对猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus, PEDV)贵州流行株(GZ2022)N基因序列进行克隆、测序，并利用DNAStar、ProtParam、ProtScale等生物信息学分析软件对PEDV-GZ2022株N基因的同源性和遗传进化地位，以及N蛋白的分子特征和潜在功能进行分析预测。结果表明：PEDV-GZ2022株N基因大小约为1 364 bp,编码441个氨基酸；PEDV-GZ2022株N基因核苷酸序列与GenBank中的PEDV参考毒株N基因的相似性为95.5%～99.8%,与PEDV经典毒株CV777 N基因核苷酸序列的相似性为95.6%,与SDLY2020毒株N基因核苷酸序列的相似性高达99.8%,PEDV-GZ2022毒株与经典毒株CV777关系相隔较远，与PEDV变异株GⅡ-b位于同一分支；PEDV-GZ2022株N蛋白中含有较多的疏水性氨基酸，为疏水性蛋白；该蛋白质存在4个N糖基化位点和37个O糖基化位点，有31个丝氨酸、...
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| 关 键 词： | 猪流行性腹泻病毒 N基因 基因克隆 生物信息学分析 抗原性 |
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