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巨魾线粒体12SrRNA 和16SrRNA 基因克隆及多态性分析
引用本文:杜民,牛宝珍,贾梦应,刘艳红,艾加林.巨魾线粒体12SrRNA 和16SrRNA 基因克隆及多态性分析[J].西南农业大学学报,2017,39(5):83-89.
作者姓名:杜民  牛宝珍  贾梦应  刘艳红  艾加林
作者单位:1. 红河学院 云南省高校农作物优质高效栽培与安全控制重点实验室,云南 蒙自 661199; 2. 红河学院 生命科学与技术学院,云南 蒙自 661199
摘    要:运用酚-氯仿方法提取12尾采集于云南省境内河口县的巨魾DNA,利用GenBank中鮡科种类设计特异性引物进行PCR扩增和克隆,利用DNAMAN软件进行序列比对以及采用软件MEGA 4.0来分析巨魾的碱基含量、遗传距离和系统进化树.结果显示:(1)得到954bp的12S rRNA基因序列和535bp的16S rRNA基因序列各12条;(2)12尾巨魾的12S rRNA基因、16S rRNA基因以及12S rRNA基因和16S rRNA的合并基因序列的相似性分别为99.89%,99.95%,99.89%;(3)12尾巨魾的12S rRNA,16S rRNA均表现出A+T碱基含量高于G+C碱基含量;(4)12尾巨魾的平均遗传距离为0.002,转换比颠换的平均值为3.065;(5)利用Neighbor-Joining(NJ)法构建的系统进化树表明魾属单独成一支,支持率达到99%,这一结果与传统的形态学分类基本相似.

关 键 词:巨魾    12S  rRNA基因    16S  rRNA基因    系统进化  

Gene Cloning and Polymorphism Analysis of Mitochondrial 12S rRNA and 16S rRNA of Bagarius yarrelli
DU Min,NIU Bao-zhen,JIA Meng-ying,LIU Yan-hong,AI Jia-lin.Gene Cloning and Polymorphism Analysis of Mitochondrial 12S rRNA and 16S rRNA of Bagarius yarrelli[J].Journal of Southwest Agricultural University,2017,39(5):83-89.
Authors:DU Min  NIU Bao-zhen  JIA Meng-ying  LIU Yan-hong  AI Jia-lin
Abstract:
Keywords:
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