不同核数的灵芝菌丝体转录组比较分析 |
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引用本文: | 王红丽,杨扬,胡学博.不同核数的灵芝菌丝体转录组比较分析[J].湖北农业科学,2023(12):200-205+235. |
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作者姓名: | 王红丽 杨扬 胡学博 |
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作者单位: | 华中农业大学植物科学技术学院/药用植物研究所/“科创中国”“一带一路”国际中药材科技产业创新院/药用植物繁育与栽培国家地方联合工程研究中心/药用植物湖北省工程研究中心 |
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摘 要: | 以野生灵芝Ganoderma lucidum(Leyss. ex Fr.)Karst.](D)、自然单核灵芝(Mo)、双核灵芝(Mu)的菌丝体为材料,利用高通量测序技术筛选差异表达基因,并进行GO分析和KEGG富集分析。通过差异基因分析,筛选出568个差异表达基因。GO分析结果表明,野生灵芝(D)与自然单核灵芝(Mo)菌丝体的差异表达基因主要富集在转录调控及DNA模板化、tRNA氨酰化、组蛋白甲基化等过程;野生灵芝(D)与双核灵芝(Mu)菌丝体的差异表达基因主要富集在染色质沉默、L-丝氨酸代谢、硫化合物代谢等过程;自然单核灵芝(Mo)与双核灵芝(Mu)菌丝体的差异表达基因主要富集在染色质沉默、DNA模板转录、谷氨酸分解等过程。KEGG富集结果表明,自然单核灵芝(Mo)与双核灵芝(Mu)菌丝体在代谢通路上有明显的差异,差异基因主要被注释到过氧化物酶、维生素代谢等通路。野生灵芝(D)与自然单核灵芝(Mo)菌丝体、野生灵芝(D)与双核灵芝(Mu)菌丝体的差异基因并没有KEGG富集的结果,说明其代谢通路没有明显差异。筛选出3个品系中表达量差异均显著的基因,共12个,并对基因的主要功能进行预测...
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关 键 词: | 灵芝[Ganoderma lucidum(Leyss. ex Fr.)Karst.] 转录组 菌丝体核数 |
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