基于线粒体COⅠ和COⅡ基因的沙果小食心虫与梨小食心虫的分子鉴定 |
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引用本文: | 王 康,李玉婷,郑 燕,等.基于线粒体COⅠ和COⅡ基因的沙果小食心虫与梨小食心虫的分子鉴定[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2016,44(2):156-164. |
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作者姓名: | 王 康 李玉婷 郑 燕 等 |
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作者单位: | 西北农林科技大学 植物保护学院,农业部西北黄土高原作物有害生物综合治理重点实验室,植保资源与病虫害治理教育部重点实验室,西北农林科技大学 植物保护学院,农业部西北黄土高原作物有害生物综合治理重点实验室,植保资源与病虫害治理教育部重点实验室,西北农林科技大学 植物保护学院,农业部西北黄土高原作物有害生物综合治理重点实验室,植保资源与病虫害治理教育部重点实验室 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31071687);教育部高等学校博士学科点专项科研基金(博导类)项目(20110204110001);西北农林科技大学人才引进项目;国家科技支撑计划项目(2012BAK11B03) |
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摘 要: | 【目的】建立基于线粒体COⅠ和COⅡ基因序列的沙果小食心虫、梨小食心虫分子鉴定方法。【方法】田间采集试虫,利用PCR和基因测序技术,扩增2种食心虫的线粒体COⅠ和COⅡ基因,将获得的COⅠ和COⅡ基因序列在GenBank中进行BLAST比对,并通过GeneDoc软件分析基因序列相似性,利用Mega 5.05软件分别计算基于COⅠ和COⅡ基因序列的遗传距离,并分别构建COⅠ和COⅡ基因的系统发育树。【结果】在分析的2种食心虫样本中,沙果小食心虫COⅠ基因的种内相似度在99.4%以上,梨小食心虫COⅠ基因的种内相似度在99.6%以上,2种食心虫COⅠ基因的种间相似度为95.0%~95.6%;沙果小食心虫COⅡ基因的种内相似度在99.0%以上,梨小食心虫COⅡ基因的种内相似度在99.3%以上,2种食心虫COⅡ基因的种间相似度为94.6%~95.5%;2种食心虫COⅠ基因种间存在30个稳定变异位点,COⅡ基因种间有26个稳定变异位点。2种食心虫种内遗传距离为0.001~0.006(COⅠ)和0.001~0.010(COⅡ),种间遗传距离为0.046~0.052(COⅠ)和0.047~0.057(COⅡ),基于COⅠ和COⅡ基因的种间遗传距离均显著大于种内遗传距离。分别构建COⅠ和COⅡ基因单倍型的系统发育树,结果显示,在2个基因的系统发育树上,2种食心虫的基因序列分别位于不同的进化支,且置信度均达到100%,同种食心虫的基因序列位于相同的进化枝。【结论】可以根据本研究所用的COⅠ和COⅡ基因序列的差异性,进行沙果小食心虫和梨小食心虫的分子鉴定。
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关 键 词: | 沙果小食心虫 梨小食心虫 COⅠ基因 COⅡ基因 单倍型 分子鉴定 |
收稿时间: | 2014/6/30 0:00:00 |
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