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茎瘤芥酸性核糖体蛋白P1基因的克隆与序列分析
引用本文:向浏欣,付于银,王秋娟,冉燕子,李露,蔡应繁. 茎瘤芥酸性核糖体蛋白P1基因的克隆与序列分析[J]. 广东农业科学, 2012, 39(19): 120-123. DOI: 10.3969/j.issn.1004-874X.2012.19.039
作者姓名:向浏欣  付于银  王秋娟  冉燕子  李露  蔡应繁
作者单位:1.重庆邮电大学生物信息学院,重庆,400065;2.重庆邮电大学生物信息学院,重庆,400065;3.重庆邮电大学生物信息学院,重庆,400065;4.重庆邮电大学生物信息学院,重庆,400065;5.重庆邮电大学生物信息学院,重庆,400065;6.重庆邮电大学生物信息学院,重庆,400065
基金项目:国家自然科学基金,重庆市科技攻关项目,重庆市自然科学基金
摘    要:以茎瘤芥幼苗叶片总RNA为模板,通过SMART RACE技术进行反转录和PCR扩增,克隆到瘤芥酸性核糖体蛋白P1 基因(命名为BjARPP1,GenBank登录号:JX282179),并利用ProtParam、DNAMAN等生物信息学工具对其核酸序列和蛋白序列进行分析.结果表明,茎瘤芥酸性核糖体蛋白P1基因开放阅读框为342 bp,编码113个氨基酸,等电点为4.27,相对分子质量为11.25 ku:二级结构预测显示α-螺旋占53.98%、不规则卷曲占33.68%、延伸链占12.39%,还含有5个磷酸化位点;同源进化树预测分析其与拟南芥的同源性为96%,与其他物种同源性低.茎瘤芥酸性核糖体蛋白P1基因为首次克隆,为进一步研究该基因的结构、功能、遗传变异规律以及其与生产性能的关系提供科学依据.

关 键 词:茎瘤芥  酸性核糖体蛋白P1基因  克隆  序列分析

Cloning and sequencing of acidic ribosomal protein P1 cDNA in Brassica juncea var.tumida Tsen et Lee
XIANG Liu-xin , FU Yu-yin , WANG Qiu-juan , RAN Yan-zi , LI Lu , CAI Ying-fan. Cloning and sequencing of acidic ribosomal protein P1 cDNA in Brassica juncea var.tumida Tsen et Lee[J]. Guangdong Agricultural Sciences, 2012, 39(19): 120-123. DOI: 10.3969/j.issn.1004-874X.2012.19.039
Authors:XIANG Liu-xin    FU Yu-yin    WANG Qiu-juan    RAN Yan-zi    LI Lu    CAI Ying-fan
Abstract:
Keywords:
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