玉米蔗糖转运蛋白基因ZmSUT3J的克隆及生物信息学分析 |
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作者单位: | 吉林省农业科学院农业生物技术研究所,吉林省农业生物技术重点实验室,长春,130033;吉林省农业科学院农业生物技术研究所,吉林省农业生物技术重点实验室,长春,130033;吉林师范大学生命科学学院,四平,136000;吉林师范大学生命科学学院,四平,136000 |
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基金项目: | 吉林省科技发展计划;吉林省农业科技创新工程项目 |
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摘 要: | 植物蔗糖转运蛋白是植物中特有的一类跨膜蛋白,负责蔗糖经韧皮部从源到库的运输以及库组织的蔗糖供给。为了解析单子叶特异的玉米蔗糖转运蛋白基因ZmSUT3的生物学功能,本研究利用RT-PCR方法,从玉米自交系‘吉853’的基因组中克隆得到蔗糖转运蛋白ZmSUT3基因,命名为ZmSUT3J。测序结果表明:开放阅读框(ORF)长度为1 527 bp,编码508个氨基酸的蛋白质即ZmSUT3,分子量为53.51 kD。利用生物信息学的方法分析ZmSUT3蛋白属于疏水的MFS蛋白超家族,含有多个磷酸化位点,主要定位在质膜和叶绿体类囊体膜上,具有12个弯曲交叉的螺旋结构,属于跨膜蛋白。系统进化树分析表明,ZmSUT3蛋白属于SUT3亚族,与高粱的Sb SUT3亲缘关系较近。启动子区域生物信息学分析结果显示,含有多个组织特异性调控元件,还有激素调节及胁迫诱导相关顺式作用元件,推测ZmSUT3在库组织中发挥作用,参与激素相关胁迫应答反应。为验证ZmSUT3J基因的生物学功能,本研究构建了植物表达载体,为研究ZmSUT3在玉米中的功能奠定了基础。
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关 键 词: | 玉米(Zea mays) 蔗糖转运蛋白 基因克隆 生物信息学分析 |
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