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枣裂果相关的基因筛选
作者单位:塔里木大学植物科学学院,南疆特色果树高效优质栽培与深加工技术国家地方联合工程实验室,新疆生产建设兵团南疆特色果树生产工程实验室,新疆生产建设兵团塔里木盆地生物资源保护与利用重点实验室,阿拉尔,843300
基金项目:国家自然科学基金;兵团中青年科技创新领军人才计划项目;国家科技支撑计划
摘    要:为了解枣果实开裂与基因表达的关系,并筛选出与裂果相关的基因,本研究以易裂品种‘伏脆蜜’为材料,利用Illumina测序平台对裂果和非裂果部位果皮进行转录组测序分析,结果表明裂果部位和非裂果部位两个样品中分别获得10 025和10 041个表达基因,其中9 802个基因在两个样品中都有表达,有223个基因在裂果部位中特异表达,有239个基因在非裂果部位中特异表达;在裂果果皮部位对比非裂果果皮部位中筛选出差异表达基因161个,其中上调表达基因39个,下调表达基因122个。通过对基因功能和KEGG代谢通路上基因差异表达筛选,主要在合成木质素的通路上发现2个基因(gene16874和gene17086);在植物激素信号转导中,发现1个AUX/IAA (gene26281)、1个ARF (gene22744)和1个SAUR (gene7576)及1个JAZ(gene2607)基因;在植物病原体相互作用代谢通路中,2个CML (gene19427和gene19466)基因;在淀粉和蔗糖代谢通路中,有1个β-淀粉酶(gene32293)基因和1个Endoglucanase 12 (gene3673)基因。结合转录组数据分析和利用RT-qPCR验证,上述10个差异表达基因在裂果果皮中都高表达,说明这10个基因可能参与裂果的发生过程。

关 键 词:裂果  果皮  转录组  RT-qPCR
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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