大黄鱼冰鲜杂鱼饲料中细菌多样性研究 |
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作者姓名: | 王勇忠 徐晓津 鄢庆枇 熊何健 邓霏 马英 |
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作者单位: | [1]集美大学水产学院,农业部东海海水健康养殖重点实验室,福建厦门361021 [2]集美大学生物工程学院,福建厦门361021 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31272669);厦门市科技局项目(2012S0486);厦门市海洋与渔业局项目(201309050001) |
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摘 要: | 为研究大黄鱼(Larimichthys crocea)冰鲜杂鱼饲料中细菌的多样性,用细菌通用引物构建了细菌16S rRNA基因克隆文库。从文库中随机挑选125个克隆子进行限制性片段长度多态性( RFLP)分析,得到82个不同的RFLP 带型。对部分代表性克隆子进行测序,得到23条有效序列。序列同源性分析和系统进化分析结果表明,大黄鱼冰鲜杂鱼饲料中细菌主要分为3大类群,其中γ-变形菌纲(γ-Proteobacteria)细菌占据明显地优势地位,约占所分析克隆子数的84.4%;其次是黄杆菌纲(Flavobacteria)细菌,约占10.9%;还有少量的梭杆菌纲(Fusobac-teria)细菌,约占4.7%。γ-变形菌纲细菌中以嗜冷杆菌(Psychrobacter sp.)最多,其次是发光杆菌(Photobacteri-um)。
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关 键 词: | 大黄鱼 养殖饲料 细菌 16S rRNA 基因 RFLP |
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