| 猪流行性腹泻病毒的分离鉴定及其M蛋白截段基因编码氨基酸的生物学分析 |
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| 引用本文： | 蒋梅,王印,杨泽晓,姚雪萍,彭彬,刘波,邬旭龙,次仁群宗. 猪流行性腹泻病毒的分离鉴定及其M蛋白截段基因编码氨基酸的生物学分析[J]. 中国兽医学报, 2013, 33(2): 195-200 |
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| 作者姓名： | 蒋梅 王印 杨泽晓 姚雪萍 彭彬 刘波 邬旭龙 次仁群宗 |
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| 作者单位： | 1. 四川农业大学动物医学院,四川雅安,625014
2. 西藏那曲班戈县农牧科学技术服务站,西藏那曲,852500 |
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| 基金项目： | 教育部《长江学者和创新团队发展计划》创新团队资助项目(IRT0848);四川农业大学双支计划资助项目(00270401) |
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| 摘 要： | 利用PK-15细胞从四川省某猪场发病死亡的7日龄仔猪肠系膜淋巴结和脱落的肠黏膜材料中分离获得1株病毒,PCR检测证实为猪流行性腹泻病毒,命名为SC-405.对其M截段基因克隆后进行测序,结果显示该基因长664bp,编码221个氨基酸；序列分析并通过NCBI做序列比对,与其他已知的GenBank公布的序列同源性为97％～99％；氨基酸序列有突变,同源性为95％～99％；系统进化树表明该病毒跟序列号为AEQ29504、ACA81419、AEE38481序列的亲缘关系比较近；用DNAStar Protean模块对该基因编码的蛋白进行主要的抗原指数、二级结构、蛋白质骨架柔性、表面可及性等参数进行预测,并在线预测该蛋白的亲水性及跨膜区,确定该截段基因的B细胞抗原优势表位可能分布在Leu12-Asn14、Lys36、Trp100 Thr113、Val196-Asp202和Asp215-Glu217这些区段.
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| 关 键 词： | 猪流行性腹泻病毒 M基因 系统进化分析 抗原表位 |
Biological analysis of the amino acid encoded by the truncated M gene after isolation and identification of porcine epidemic diarrhea virus |
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| Affiliation: | JIANG Mei1,WANG Yin1,YANG Ze-xiao1,YAO Xue-ping1,PENG Bin1,LIU Bo1,WU Xu-long1,TSERING Choezom2(1.College of Veterinary Medicine,Sichuan Agricultural University,Ya′an,Sichuan 625014,China;2.Tibet Naqu County of Agricultural Science and Technology Service Station,Naqu,Tibet 852500,China) |
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