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基于网络药理学和分子对接探讨高频调髓中药治疗股骨头坏死的作用机制
引用本文:汪正明,王瑞,金钊锴,吕帅洁,金红婷,肖鲁伟,詹红生.基于网络药理学和分子对接探讨高频调髓中药治疗股骨头坏死的作用机制[J].特产研究,2023(4):74-81.
作者姓名:汪正明  王瑞  金钊锴  吕帅洁  金红婷  肖鲁伟  詹红生
作者单位:1. 上海中医药大学附属曙光医院石氏伤科医学中心;2. 上海市中医药研究院骨伤科研究所;3. 浙江中医药大学附属第一医院(浙江省中医院)
基金项目:上海市临床重点专科“中医骨伤科”项目(shslczdzk03901);;国家自然科学基金项目项目(82074466、81873325);;上海市2021年度“科技创新行动计划”医学创新研究专项面上项目(21Y11921600);
摘    要:运用网络药理学和分子对接方法,探讨熟地、牛膝、茯苓、肉苁蓉和菟丝子等高频调髓中药治疗股骨头坏死(Osteonecrosis of the femoral head,ONFH)的作用机制。借助TCMSP平台,获取高频调髓中药的活性成分与潜在作用靶点,将上述药物作用靶点在Uniprot数据库中进行标准化处理。通过GeneCards和OMIM两大疾病数据库,获取得到ONFH疾病相关基因靶点,对所得到的已规范化的药物活性成分与疾病靶点进行整理合并,得到交集基因靶点。通过Cytoscape软件和String数据库,绘制药物-活性成分-靶点-疾病网络和构建蛋白互作网络,分析网络中关键活性成分和蛋白靶点。利用R软件对交集基因进行基因本体(Geneontology,GO)功能和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopediaof Genesand Genomes,KEGG)通路富集分析,得到交集基因富集的功能与信号通路。为了验证药物活性成分与作用靶点结合的稳定性,使用AutoDockTools和AutoDock Vina软件进行分子对接验证,并在PyMOL软件中进行可视化分析,共得到5味...

关 键 词:调髓  中药  股骨头坏死  网络药理学  分子对接
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