小麦不同营养型病原真菌的候选GPCR蛋白预测及对比研究

【目的】通过对小麦3种不同营养型病原真菌的候选GPCR蛋白进行找寻及性质对比分析，为进一步找寻新型农药作用靶标奠定理论基础。【方法】选择已经公布全基因组序列的3种小麦营养型病原真菌，基于GPCR蛋白所具有的7重跨膜结构典型特征，利用3种蛋白跨膜在线预测程序(TOPCONS、TMHMM、Philius)对上述病原真菌的候选GPCR蛋白开展找寻，以及候选GPCR蛋白序列长度、理论等电点、不稳定系数、最强亲(疏)水性残基等特征和遗传关系进行对比分析。【结果】小麦白粉病菌、叶枯病菌、叶斑病菌中分别含有候选GPCR蛋白11、32、69个，蛋白序列平均长度为396 aa。蛋白的理论等电点平均值在8.78左右，不稳定系数在40左右，亲水性在-2.70左右，疏水性在3.20左右，而最强亲(疏)水性氨基酸残基分布不一致。上述112个候选GPCR蛋白按遗传关系聚为三大类，分别具有71、36、5个蛋白。【结论】小麦不同营养型病原真菌的候选GPCR蛋白数量以活体型真菌数量最少，死体型真菌数量最多，半活体型真菌介于两者之间。不同候选GPCR蛋白在理论等电点、不稳定系数等理化性质及遗传关系等方面具有一定同质性特征...