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| 布鲁菌疫苗株A19全基因组测序及功能分析 | |
| 作者单位： | ;1.内蒙古农业大学兽医学院/农业部动物疾病临床诊疗技术重点实验室;2.内蒙古自治区综合疾病预防控制中心 |
| 摘 要： | 采用Illumina Hiseq和PacBio测序技术对布鲁菌A19进行全基因组测序,并进行GO注释、VFDB注释、ARDB注释、CRISPR以及基因岛预测等生物信息学分析。结果显示:A19全基因组大小为3.28 Mb,GC含量分布未见异常,含1个CRISPR和16个基因岛,通过GO数据库注释发现,参与生物学途径的基因5 311个、细胞组份基因有3 350个、分子功能基因有3 078个;通过VFDB注释发现,与毒力相关的基因82个,主要包括脂多糖(LPS)、纤连结合蛋白、virB四型分泌系统等毒力相关因子;通过ARDB数据库注释发现,与耐药相关的基因1个,该基因的表达产物通过影响焦磷酸异构酶的表达,从而产生对抗生素的耐药。本试验通过A19全基因组测序,为布鲁菌病的治疗和致病机制的研究及疫苗的开发奠定了基础。 |
| 关 键 词： | 布鲁菌 布鲁菌疫苗株A19 全基因组测序 功能分析 |
Whole genome sequence of Brucella vaccine strain A19 and functional analysis |
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