拟南芥基因组NBS-LRR类基因家族的生物信息学分析

【研究目的】本研究对拟南芥（Arabidopsis thaliana）中含有核苷酸结合位点（Nucleotide binding site，NBS）和富含亮氨酸的重复序列（Leucine-rich repeat，LRR）类基因进行了分析。【方法】利用TAIR、Pfam网站,数据库和Chromosome Map Tool、MEGA 3.0、ClustalX软件，分析确定NBS-LRR基因及其类型、染色体物理分布、系统发育学关系。【结果】在拟南芥全基因组中共有204 个NBS-LRR 类基因，大多位于1号和5号染色体上，其中71.6%的NBS-LRR 类基因分布在基因簇内。对NBS-LRR 类基因家族进行了氨基酸多序列比对和系统进化树分析，NBS-LRR 类基因家族可分为四个亚家族。另外，NBS-LRR基因在进化过程中存在较多的复制现象。

Bioinformatic Analysis of the NBS-LRR Gene Family in Arabidopsis thaliana