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大鲵虹彩病毒流行株的分离及其主衣壳蛋白编码基因序列比较分析
引用本文:徐进,张辉,肖汉兵,曾令兵.大鲵虹彩病毒流行株的分离及其主衣壳蛋白编码基因序列比较分析[J].中国水产科学,2014,21(4):655-661.
作者姓名:徐进  张辉  肖汉兵  曾令兵
作者单位:中国水产科学研究院长江水产研究所, 湖北 武汉 430223
基金项目:公益性行业(农业)科研专项经费资助(201203086-05); 中国水产科学研究院基本科研业务费资助(2012A0505).
摘    要:

大鲵虹彩病毒(giant salamander iridovirus, GSIV)是近年中国大陆新发现的引起人工养殖大鲵(Andrias davidianus)大规模死亡的病毒病原。为了揭示大鲵虹彩病毒流行株的基因型差异, 本研究对2010–2012年采集自全国不同大鲵养殖区域的患虹彩病毒病的大鲵样本进行了分子检测、病毒分离培养以及病毒主衣壳蛋白(major capsid protein, MCP)基因测序与比对分析。结果显示, 采自陕西、湖北、湖南、浙江、江西、福建等省的10个样本检测为阳性, 通过细胞培养获得10株病毒流行株。对该10株流行株MCP基因的测序与比对分析发现, 核苷酸序列相似性达到99.7%~100%, 其推测的氨基酸序列无明显差异, 证实中国大鲵虹彩病毒流行株属同一基因型。系统进化树分析结果表明, 所选大鲵虹彩病毒与蛙病毒分别聚为一枝, 但其亲缘关系较近。本研究结果旨为大鲵虹彩病毒病的疫苗研制及其免疫防控技术研究奠定基础。



关 键 词:大鲵虹彩病毒    流行株    主衣壳蛋白    基因序列    比对分析
修稿时间:2015/6/24 0:00:00

Isolation and analysis of MCP gene in giant salamander iridovirus epidemic strains
XU Jin,ZHANG Hui,XIAO Hanbing,ZENG Lingbing.Isolation and analysis of MCP gene in giant salamander iridovirus epidemic strains[J].Journal of Fishery Sciences of China,2014,21(4):655-661.
Authors:XU Jin  ZHANG Hui  XIAO Hanbing  ZENG Lingbing
Institution:Yangtze River Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Wuhan 430223, China
Abstract:
Keywords:giant salamander iridovirus (GSIV)  epidemic strains  major capsid protein (MCP)  gene sequence  alignment analysis
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