| 猪嵴病毒VP1基因序列测定与分析 |
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| 引用本文： | 易春华,谢齐斌,唐薇薇,朱春刚,秦长串,伍和明,韦达有.猪嵴病毒VP1基因序列测定与分析[J].南方农业学报,2016(4):670-673. |
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| 作者姓名： | 易春华 谢齐斌 唐薇薇 朱春刚 秦长串 伍和明 韦达有 |
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| 作者单位： | 1. 桂林市动物疫病预防控制中心,广西桂林,541001;2. 临桂县动物疫病预防控制中心,广西临桂,541007 |
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| 基金项目： | 广西科学研究与技术开发计划项目(桂科攻20140112) |
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| 摘 要： | 【目的】对猪嵴病毒(PKV)VP1基因进行测序与同源性分析,确认其可能来源,为今后的生物学特性分析及仔猪腹泻防治工作提供科学依据。【方法】采用RT-PCR对GXPKV-1毒株VP1基因进行克隆,运用DNASTAR软件包中Megalign程序对测序获得的VP1基因进行核苷酸序列及其推导氨基酸序列同源性分析。【结果】GXPKV-1毒株VP1基因全长762 bp,共编码254个氨基酸,与Gen Bank已公布的13株参考毒株VP1基因的核苷酸同源性为74.1%~85.4%,推导氨基酸同源性为81.1%~93.3%。根据VP1基因推导氨基酸序列进行系统发育进化分析,发现GXPKV-1毒株与Gansu-2012、JS1419等国内参考毒株同属于同一亚群,而与瑞士分离株Swine-S-1-2007、泰国分离株THA-2008、美国分离株H_24-2012-USA及四川分离株CHN-SC-2011-02等的亲缘关系较远。【结论】猪嵴病毒GXPKV-1毒株起源于国内流行毒株的传播,在新的环境下虽然其VP1基因核苷酸发生变异,但由于同义翻译,推导氨基酸的同源性仍然较高,说明碱基突变并未引起蛋白结构的改变。
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| 关 键 词： | 猪嵴病毒 VP1基因 序列测定 分析 |
Sequenceing and analysis of VP1 gene of procine kobuvirus |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | procine kobuvirus (PKV) VP1 gene sequencing analysis |
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