猪DDX家族成员基因结构与表达特性分析

为了系统研究DDX解旋酶家族成员在猪生长发育中的作用，试验采用生物信息学方法和实时荧光定量PCR检验技术，对猪DDX家族的42个成员的基因结构、理化性质、功能结构域、聚类进化树、GO功能，以及在大白猪和马身猪盲肠组织中的表达情况进行了研究。结果表明：猪DDX家族除DDX28和DDX53基因没有内含子外，其他成员均含有外显子和内含子，且外显子平均数量为16个，内含子平均数量为15个。除8号染色体外，其他染色体上均有猪DDX家族成员分布。该家族成员均为疏水蛋白并且大多数不稳定，具有多个亚细胞定位，整体来看主要分布于细胞核中。猪DDX家族成员共预测到了15个保守基序，其中DDX1、DDX11、DDX19B、DDX26、DDX36、DDX39A、DDX58和DDX60基因缺失D-E-A-D保守基序，有10个保守基序出现在超过30个成员的序列中，同时不同成员有相同的基序类型和特定的基序排列顺序。聚类分析将猪DDX家族42个成员分为6大簇，其中DDX2和DDX48、DDX21和DDX50、DDX43和DDX53、DDX5和DDX17具有高度同源性，支持率为100%。该家族大多数成员具有ATP依赖性...