杜寒杂交羊四个候选基因多态性与体尺性状的关联分析 |
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引用本文: | 季久秀,张春峰,潘章源,吕慎金,张震.杜寒杂交羊四个候选基因多态性与体尺性状的关联分析[J].黑龙江畜牧兽医,2023(1):42-48+53. |
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作者姓名: | 季久秀 张春峰 潘章源 吕慎金 张震 |
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作者单位: | 1. 临沂大学农林科学学院;2. 桂林医学院生物技术学院 |
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基金项目: | 山东省自然科学基金项目(ZR2019PC034); |
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摘 要: | 为了探寻影响杜寒杂交羊体尺性状的遗传标记,试验通过Multiplex SNaPshot技术对72只6月龄杜寒杂交羊的HMGA1、HMGA2、PLAG1和BMPR1B四个影响体型大小的候选基因中的20个SNPs位点进行了基因型分型,应用PLINK v1.07软件对单核苷酸多态性(SNPs)位点与体尺性状(体斜长、体高和管围)进行单点关联分析,利用Excel软件进行等位基因替代效应分析,并应用HaploView version 4.2软件进行单倍型构建及连锁不平衡分析。结果表明:除2个SNPs位点外,其他18个SNPs位点均存在突变基因型。HMGA1基因上游的rs405972023位点与体斜长和管围呈显著相关(P<0.05),rs404165907位点与体斜长呈显著相关(P<0.05);HMGA2基因第2内含子区域的rs399648873位点和该基因上游rs409565324位点与体高呈显著相关(P<0.05);位于PLAG1和BMPR1B基因及其周边区域的SNPs位点与杜寒杂交羊体尺性状未呈现显著相关(P>0.05)。HMGA1基因rs405972023位点TT基...
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关 键 词: | 杜寒杂交羊 HMGA1 HMGA2 PLAG1 BMPR1B 体尺性状 关联分析 |
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