| 狐、貉源犬瘟热病毒H和F基因的克隆与序列分析 |
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| 引用本文： | 闫如勋,赵建军,柴秀丽,闫喜军,倪佳,张海玲,高晗,白雪,张蕾,陈立志,吴威.狐、貉源犬瘟热病毒H和F基因的克隆与序列分析[J].江苏农业科学,2012,40(1):23-26. |
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| 作者姓名： | 闫如勋 赵建军 柴秀丽 闫喜军 倪佳 张海玲 高晗 白雪 张蕾 陈立志 吴威 |
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| 作者单位： | 1. 中国农业科学院特产研究所,吉林吉林132109;江苏科技大学生物与环境工程学院,江苏镇江212003
2. 中国农业科学院特产研究所,吉林吉林,132109
3. 中国农业科学院特产研究所,吉林吉林132109;吉林特研生物技术有限责任公司,吉林长春130122 |
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| 基金项目： | 国家农业科技成果转化资金(编号:2009GB2B100084) |
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| 摘 要： | 为研究我国圈养狐、貉流行犬瘟热病毒(canine distemper virus,CDV)的基因分型与遗传变异情况,通过RT - PCR方法扩增与测序分析了2009年来源于山东省和河北省病料中的CDVH与F基因,并分别与GenBank CDV野毒株和疫苗株的基因序列比对,构建了核苷酸序列的系统发生树.H基因系统发生分析显示,6株毒株归属为Asia -1型.H蛋白氨基酸序列比较表明,除HeB(09)3株有8个潜在N-连接的糖基化位点外,其余毒株N-连接的糖基化位点均为9个.以往的研究结果显示,日本和中国台湾分离株的潜在N-连接糖基化位点为8～9个.6株野毒F蛋白编码区氨基酸的同源性为98.0％～99.5％,与CDV3(登录号EU726268)和Onderstepoort(登录号AF305419)疫苗株的同源性为89.1％～90.6％,F蛋白的前导区(1～ 135位氨基酸)与疫苗株相比的同源性为62.2％～66.7％；野毒株F蛋白氨基酸在108～ 110处比疫苗株CDV3多1个潜在N-连接的糖基化位点,HeB(09)3的F蛋白还在366～369位多1个潜在的N-连接的糖基化位点.目前在山东省和河北省2地狐狸和貉中流行的犬瘟热野毒株为Asia -1型,HeB(09)3株H蛋白和F蛋白在N-连接糖基化方面与其他5株野毒株有明显的不同.
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| 关 键 词： | 狐狸 貉 犬瘟热病毒 血凝素蛋白基因 融合蛋白基因 遗传变异 |
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