丹参海藻糖-6-磷酸合成酶基因(SmTPS)的克隆及其表达分析 |
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作者姓名: | 岳思思 姚伟 王东浩 陈玉芹 王喆之 |
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作者单位: | 药用资源与天然药物化学教育部重点实验室,西北濒危药材资源开发国家工程实验室,陕西师范大学生命科学学院,西安710062 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(C020409)资助 |
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摘 要: | 对丹参EST序列进行Blast分析,得到一条海藻糖-6-磷酸合成酶(TPS)基因,将其命名为SmTPS,GenBank注册号为JF937196。该基因cDNA全长2836 bp,包含一个长为2574 bp的ORF,编码857个氨基酸。生物信息学分析表明,分子量为97.04 kD,等电点为5.76,含α-螺旋、β转角、延伸连和无规则卷曲。该蛋白同时具有海藻糖-6-磷酸合成酶(TPS)和海藻糖-6-磷酸磷酸酯酶(TPP)的功能结构域。系统进化树分析表明丹参TPS功能域和拟南芥AtTPS6属于一类,而TPP功能域与低等生物酵母ScTPS2属于一类。实时定量PCR结果分析表明,SmTPS基因在丹参不同组织器官中差异表达,其茎中表达量最高。在干旱和低温处理下,其表达量与对照相比均可上调约2倍,表明SmTPS基因在丹参抵抗干旱和低温胁迫中发挥一定的作用。
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关 键 词: | 丹参 海藻糖 基因克隆 表达分析 |
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