副猪嗜血杆菌OMP5基因的克隆及生物信息学分析

根据GenBank上公布的副猪嗜血杆菌外膜蛋白OMP5基因的核苷酸序列，设计1对特异性引物，对贵州省HPS分离株OMP5基因进行扩增。结果表明所扩增的OIvIP5基因的长度为1116bp，与SH0165株对应的核苷酸序列和氨基酸同源性均为lOO％。生物信息学分析结果表明，OMP5基因所编码的外膜蛋白P5的理论等电点pl为9．34不稳定系数为20．44，推测其为稳定性蛋白；脂肪指数为83．94，总体平均亲水性为-0．172，推测该蛋白是一种亲水性蛋白；该蛋白含有丰富的α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规则卷曲，无跨膜区，最前端的21个N-末端氨基酸残基为信号肽序列并且主要为疏水性氨基酸，最佳切割位点在第21～22个氨基酸之间；结构位点预测表明该蛋白含有多个不同的糖基化和磷酸化位点。