凡纳滨对虾E75基因可变剪切形式的鉴定与分析 |
| |
作者姓名: | 杜江丽 张晓军 张小溪 袁剑波 高羿 李富花 相建海 |
| |
作者单位: | 中国科学院海洋研究所, 实验海洋生物学重点实验室, 山东 青岛 266071;青岛海洋科学与技术国家实验室, 海洋生物学与生物技术功能实验室, 山东 青岛 266237;中国科学院大学, 北京 100049,中国科学院海洋研究所, 实验海洋生物学重点实验室, 山东 青岛 266071;青岛海洋科学与技术国家实验室, 海洋生物学与生物技术功能实验室, 山东 青岛 266237,中国科学院海洋研究所, 实验海洋生物学重点实验室, 山东 青岛 266071;青岛海洋科学与技术国家实验室, 海洋生物学与生物技术功能实验室, 山东 青岛 266237;中国科学院大学, 北京 100049,中国科学院海洋研究所, 实验海洋生物学重点实验室, 山东 青岛 266071;青岛海洋科学与技术国家实验室, 海洋生物学与生物技术功能实验室, 山东 青岛 266237,中国科学院海洋研究所, 实验海洋生物学重点实验室, 山东 青岛 266071;青岛海洋科学与技术国家实验室, 海洋生物学与生物技术功能实验室, 山东 青岛 266237,中国科学院海洋研究所, 实验海洋生物学重点实验室, 山东 青岛 266071;青岛海洋科学与技术国家实验室, 海洋生物学与生物技术功能实验室, 山东 青岛 266237,中国科学院海洋研究所, 实验海洋生物学重点实验室, 山东 青岛 266071;青岛海洋科学与技术国家实验室, 海洋生物学与生物技术功能实验室, 山东 青岛 266237 |
| |
基金项目: | 国家自然科学基金(31672632,31702320,41876167) |
| |
摘 要: | E75是对虾蜕皮激素信号通路的关键调控因子。为了深入了解E75基因的结构和功能,本实验从转录组数据中筛选得到注释为凡纳滨对虾E75基因的转录本,经与基因组序列比对分析,鉴定发现凡纳滨对虾E75基因至少存在6种可变剪接体,分别命名为LvE75-1、LvE75-2、LvE75-3、LvE75-4、LvE75-5和LvE75-6。其中LvE75-1/2/4/5/6均包含DBD和LBD结构域,与果蝇E75A/C有相同的结构域,而LvE75-3仅包含LBD结构域,与果蝇E75D相同。在凡纳滨对虾蜕皮过程中,LvE75-1/2/3/4在D3~D4时期高表达,而LvE75-5和LvE75-6表达量很低。在成体组织中,LvE75各种剪切形式在所有检测的组织中均有表达,且在表皮、肠和鳃中表达较高,在肝胰脏、血细胞和淋巴组织中仅LvE75-3表达较高。实验通过双链RNA干扰LvE75基因的表达,在干扰样品中,检测到Halloween基因中的spo、phm和dib表达下调,shd表达上调,表明LvE75可能通过调控Halloween基因的表达来影响蜕皮激素的合成;同时E75基因的干扰也使同为蜕皮激素早期应答基因的Br-C基因和Ftz-F1基因表达下调,HR3基因表达上调,表明LvE75基因对蜕皮信号通路上下游基因均有作用。在LvE75基因持续干扰12 d后,凡纳滨对虾的蜕皮率显著低于对照组,而死亡率显著高于对照组,说明LvE75基因对凡纳滨对虾的蜕皮和生存具有重要作用。
|
关 键 词: | 凡纳滨对虾 E75基因 蜕皮 可变剪接 RNA干扰 |
收稿时间: | 2018-01-08 |
修稿时间: | 2018-06-24 |
本文献已被 CNKI 等数据库收录! |
| 点击此处可从《水产学报》浏览原始摘要信息 |
|
点击此处可从《水产学报》下载免费的PDF全文 |
|