| 谷子种子白发病菌带菌检测及种群多态性分析 |
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| 引用本文： | 宋振君,李志勇,王永芳,任世龙,白辉,董志平.谷子种子白发病菌带菌检测及种群多态性分析[J].植物保护学报,2019,46(3):651-657. |
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| 作者姓名： | 宋振君 李志勇 王永芳 任世龙 白辉 董志平 |
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| 作者单位： | 河北省农林科学院谷子研究所, 国家谷子改良中心, 河北省杂粮重点实验室, 石家庄 050035;河北师范大学生命科学学院, 石家庄 050024,河北省农林科学院谷子研究所, 国家谷子改良中心, 河北省杂粮重点实验室, 石家庄 050035,河北省农林科学院谷子研究所, 国家谷子改良中心, 河北省杂粮重点实验室, 石家庄 050035,河北省农林科学院谷子研究所, 国家谷子改良中心, 河北省杂粮重点实验室, 石家庄 050035,河北省农林科学院谷子研究所, 国家谷子改良中心, 河北省杂粮重点实验室, 石家庄 050035,河北省农林科学院谷子研究所, 国家谷子改良中心, 河北省杂粮重点实验室, 石家庄 050035 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（31872880），河北省农林科学院创新工程（2019-4-2-3），国家现代农业产业技术体系（CARS-07-13.5-A8） |
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| 摘 要： | 为检测不同地区谷子种子携带白发病菌Sclerospora graminicola的情况以及种群多态性,以我国谷子不同主产区收集的95份代表性谷子品种种子为材料,提取种子基因组DNA并作模板,利用白发病菌28S rRNA序列设计特异性引物进行PCR扩增,将所获得的PCR产物测序后与白发病菌28S rRNA序列进行比对。结果表明,特异性引物Sg-28S-403-F/Sg-28S-1221-R对白发病菌具有高度的特异性,扩增出819 bp的特异性目标片段,有效检测灵敏度为0.125 ng/μL。在95份谷子种子中,26份种子检测出特异性扩增条带,所有扩增条带对应序列与白发病菌28S rRNA序列的相似性达98%以上,并且带菌种子全部来自春谷区。分析26份阳性样品的28S rRNA序列,得到58个变异位点和34种单倍型,其中单倍型SG2出现频率最高,内蒙古、陕西、山西、河北和辽宁省区的白发病菌都具有该单倍型,表明不同地理来源的白发病菌28S rRNA序列存在差异,SG2为优势单倍型。
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| 关 键 词： | 谷子 白发病菌 种子带菌 聚合酶链式反应 单倍型 |
| 收稿时间： | 2018/11/30 0:00:00 |
Detection and population diversity analysis of the contamination of millet seeds with Sclerospora graminicola |
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| Song Zhenjun,Li Zhiyong,Wang Yongfang,Ren Shilong,Bai Hui and Dong Zhiping.Detection and population diversity analysis of the contamination of millet seeds with Sclerospora graminicola[J].Acta Phytophylacica Sinica,2019,46(3):651-657. |
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| Authors: | Song Zhenjun Li Zhiyong Wang Yongfang Ren Shilong Bai Hui and Dong Zhiping |
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| Institution: | Minor Cereal Crops Laboratory of Hebei Province, National Foxtail Millet Improvement Center, Institute of Millet Crops of Hebei Academy of Agricultural and Forestry Sciences, Shijiazhuang 050035, Hebei Province, China;College of Life Sciences, Hebei Normal University, Shijiazhuang 050024, Hebei Province, China,Minor Cereal Crops Laboratory of Hebei Province, National Foxtail Millet Improvement Center, Institute of Millet Crops of Hebei Academy of Agricultural and Forestry Sciences, Shijiazhuang 050035, Hebei Province, China,Minor Cereal Crops Laboratory of Hebei Province, National Foxtail Millet Improvement Center, Institute of Millet Crops of Hebei Academy of Agricultural and Forestry Sciences, Shijiazhuang 050035, Hebei Province, China,Minor Cereal Crops Laboratory of Hebei Province, National Foxtail Millet Improvement Center, Institute of Millet Crops of Hebei Academy of Agricultural and Forestry Sciences, Shijiazhuang 050035, Hebei Province, China,Minor Cereal Crops Laboratory of Hebei Province, National Foxtail Millet Improvement Center, Institute of Millet Crops of Hebei Academy of Agricultural and Forestry Sciences, Shijiazhuang 050035, Hebei Province, China and Minor Cereal Crops Laboratory of Hebei Province, National Foxtail Millet Improvement Center, Institute of Millet Crops of Hebei Academy of Agricultural and Forestry Sciences, Shijiazhuang 050035, Hebei Province, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | millet Sclerospora graminicola seed-borne polymerase chain reaction (PCR) haplotype |
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