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萝卜根径发育候选基因的初步筛选
引用本文:杜雪玲,马媛媛,程洋洋,何 军,宋运贤,余如刚.萝卜根径发育候选基因的初步筛选[J].西北农业学报,2019,28(4):567-577.
作者姓名:杜雪玲  马媛媛  程洋洋  何 军  宋运贤  余如刚
作者单位:(1.淮北师范大学 生命科学学院,安徽淮北 235000;2.北京阳光绿地生态科技有限公司,北京 100083)
基金项目:国家自然科学基金(31671599);安徽省高校省级自然科学项目(KJ2016B014);安徽自然科学基金(1708085MC55)。
摘    要:为了鉴定调控不同萝卜品种间根大小性状差异的关键基因,利用基于高通量测序的数字基因表达谱(DGE)技术,对2种根直径大小不同的圆球形萝卜‘扬州圆白’(直径大)和‘萨丁’(直径小)进行差异表达基因分析。测序共获得1 468个差异表达转录本。基于基因功能注释分析,共鉴定到参与细胞壁代谢相关的转录本28个,参与蔗糖代谢相关的转录本2个,参与激素合成与信号转导相关的转录本29个。利用RT-qPCR分析对6个细胞壁代谢相关基因的表达模式进行验证,其结果与测序结果基本一致。研究发现参与植物激素合成与激素信号转导相关基因(TIFYs、DELLA、 ERF2和 CYCD3)、蔗糖代谢相关基因( ATBETAFRUCT4和 HK3)和细胞壁代谢相关基因(XTHs、EXPs和COBs)可能是调控‘扬州圆白’和‘萨丁’萝卜根大小品种间差异的关键基因。

关 键 词:数字基因表达谱  萝卜    大小  基因

Screening for Candidate Gene Involved in Taproot Diameter Development of Radish
DU Xueling,MA Yuanyuan,CHENG Yangyang,HE Jun,SONG Yunxian and YU Rugang.Screening for Candidate Gene Involved in Taproot Diameter Development of Radish[J].Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica,2019,28(4):567-577.
Authors:DU Xueling  MA Yuanyuan  CHENG Yangyang  HE Jun  SONG Yunxian and YU Rugang
Abstract:
Keywords:Digital gene expression profiling  Radish  Root  Size  Gene
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