| 应用PCR-DGGE技术比较绵羊瘤胃、网胃、瓣胃和皱胃菌群的多样性 |
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| 引用本文： | 曾燕,曾东,倪学勤,张艳,祝辉,唐雨蕊.应用PCR-DGGE技术比较绵羊瘤胃、网胃、瓣胃和皱胃菌群的多样性[J].动物营养学报,2015(1):298-304. |
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| 作者姓名： | 曾燕 曾东 倪学勤 张艳 祝辉 唐雨蕊 |
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| 作者单位： | 四川农业大学动物医学院动物微生态研究中心，动物疫病与人类健康四川省重点实验室，雅安 625014 |
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| 基金项目： | 教育部留学回国人员科研启动基金资助项目，四川省学术带头人培养基金 |
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| 摘 要： | 本研究采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术结合DGGE图谱条带的克隆和测序比较了绵羊瘤胃、网胃、瓣胃和皱胃菌群的多样性,同时对菌群进行了聚类分析和主成分分析。结果表明:绵羊瘤胃、网胃、瓣胃和皱胃内容物DGGE图谱的平均条带数分别为18、13、16和15条;瘤胃和瓣胃内菌群的多样性指数、均匀度和丰富度均较高,分别为2.83、0.79、17.00和2.82、0.79、16.80,而网胃和皱胃内容物较低,分别为2.52、0.70、12.60和2.73、0.76、15.40;聚类分析结果显示不同胃的内容物菌群具有一定差异,但不同动物个体相同胃的内容物相似性系数均高于0.63;PCR-DGGE图谱中测序的条带大多数归为拟杆菌门(Bacteroidetes)和厚壁菌门(Firmicutes),优势菌群为厚壁菌门(Firmicutes)细菌、拟杆菌门(Bacteroidetes)细菌、未培养瘤胃细菌(uncultured rumen bacterium)、未培养细菌(uncultured bacterium)和韦荣球菌科(Veillonellaceae)细菌,特异性细菌为不动杆菌属(Acinetobacter sp.)细菌和瘤胃球菌属(Ruminococcaceae)细菌。结果提示,绵羊4个胃中均含有种类丰富和数量巨大的细菌,且随着消化道部位由前往后的顺序,菌群的多样性呈现先高后降低再升高的趋势。
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| 关 键 词： | 绵羊 胃 细菌 PCR-DGGE 聚类分析 主成分分析 |
A Comparison Study on Bacteria Diversity of Rumen,Reticulum, Omasum and Abomasum from Sheep Using PCR-DGGE Analysis |
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| ZENG Yan;ZENG Dong;NI Xueqin;ZHANG Yan;ZHU Hui;TANG Yurui.A Comparison Study on Bacteria Diversity of Rumen,Reticulum, Omasum and Abomasum from Sheep Using PCR-DGGE Analysis[J].Acta Zoonutrimenta Sinica,2015(1):298-304. |
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| Authors: | ZENG Yan;ZENG Dong;NI Xueqin;ZHANG Yan;ZHU Hui;TANG Yurui |
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| Institution: | ZENG Yan;ZENG Dong;NI Xueqin;ZHANG Yan;ZHU Hui;TANG Yurui;Institute of Animal Microecology,College of Veterinary Medicine,Sichuan Agricultural University,Key Laboratory of Animal Disease and Human Health of Sichuan Province; |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | sheep stomach bacteria PCR-DGGE cluster analysis PCA |
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