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中国水禽新城疫病毒F和HN基因的变异趋势
引用本文:徐怀英,秦卓明,王友令,欧阳文军,谭雷涛,何叶峰,金维江,袁小远. 中国水禽新城疫病毒F和HN基因的变异趋势[J]. 畜牧兽医学报, 2009, 40(3)
作者姓名:徐怀英  秦卓明  王友令  欧阳文军  谭雷涛  何叶峰  金维江  袁小远
作者单位:山东农业科学院家禽研究所,济南,250100
基金项目:山东省科技攻关重点支持项目,山东省农科院创新基金 
摘    要:选取中国1996-2005年的8株鹅、鸭等水禽NDV流行株,克隆其融合蛋白(F)和血凝素-神经氨酸酶(HN)基因,参考GenBank中具有F和HN核苷酸全长的16株国内外NDV代表株、16株国内水禽流行株以及12株只具有F基因的水禽毒株序列,参照传统F基因分型方法,分别对F和HN基因进行分型,同时进行相关比较、核苷酸和氨基酸同源性以及系统发育分析。结果表明:16株国内外代表株F和HN基因分型基本一致,但24株水禽NDV流行株中只有15株相同,符合率为62.5%,不同占37.5%(9/24)。系统发育和同源比较发现:水禽NDV流行株HN基因高度同源,同属Ⅶ型,而F基因则分属不同的基因型。通过对24株NDVF和HN基因氨基酸全长以及进行F基因分型的F基因47-420位核苷酸的同源性相关性比较证实:F基因前47-420位核苷酸的遗传变异与F基因氨基酸全长变异密切相关,r=0.916,但与HN基因的氨基酸变异不相关,显示出NDV在演变过程中F和HN基因具有相对的独立性。水禽NDV是家禽NDV的重要储存宿主,应高度重视水禽NDV的变异。

关 键 词:新城疫病毒  F基因  HN基因  同源性  遗传变异  相关性

Tendency of Genetic Variation on the F and HN Genes of Newcastle Disease Viruses Isolated from Waterfowls in China
XU Huai-ying,QIN Zhuo-ming,WANG You-ling,OUYANG Wen-jun,TAN Lei-tao,HE Ye-feng,JIN Wei-jiang,YUAN Xiao-yuan. Tendency of Genetic Variation on the F and HN Genes of Newcastle Disease Viruses Isolated from Waterfowls in China[J]. Chinese Journal of Animal and Veterinary Sciences, 2009, 40(3)
Authors:XU Huai-ying  QIN Zhuo-ming  WANG You-ling  OUYANG Wen-jun  TAN Lei-tao  HE Ye-feng  JIN Wei-jiang  YUAN Xiao-yuan
Abstract:
Keywords:
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