| 确山黑猪HOXA5基因组织表达及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 段栋栋,李聪,李梦雨,李欣,王克君,李秀领,韩雪蕾,乔瑞敏,李新建.确山黑猪HOXA5基因组织表达及生物信息学分析[J].河南农业大学学报,2022,56(2):281-289. |
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| 作者姓名： | 段栋栋 李聪 李梦雨 李欣 王克君 李秀领 韩雪蕾 乔瑞敏 李新建 |
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| 作者单位： | 河南农业大学动物科技学院,河南 郑州 450046 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(U1804106)； |
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| 摘 要： | 【目的】探究确山黑猪HOXA5基因的组织表达情况和HOXA5蛋白的结构功能。【方法】利用实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,qRT-PCR)技术检测HOXA5基因在确山黑猪各组织中的表达情况，并与大白猪皮下脂肪和背最长肌进行对比；以确山黑猪皮下脂肪组织为cDNA模板，克隆确山黑猪HOXA5基因编码(coding sequence, CDS)区序列，利用生物信息学软件分析确山黑猪HOXA5基因CDS区序列及其编码蛋白质的结构和功能。【结果】HOXA5基因在确山黑猪肺脏中表达量最高，其次是肝脏和皮下脂肪，且显著高于其他组织。同时，HOXA5基因在确山黑猪皮下脂肪组织中表达量显著高于大白猪。通过对确山黑猪HOXA5基因进行克隆及生物信息学分析，获得的确山黑猪HOXA5基因CDS区全长813 bp,编码270个氨基酸，与牛、绵羊、马、黑猩猩、小鼠、人和鸡的同源性分别为99.1%、99.0%、98.8%、97.8%、97.4%、95.6%和81.3%。确山黑猪HOXA5蛋白分子质量为29.28 kD,主要位于细胞核内，属于酸性、亲水性蛋白，且不具有跨膜结构和...
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| 关 键 词： | 确山黑猪 大白猪 HOXA5基因 基因克隆 组织表达 生物信息学分析 |
Tissue expression and bioinformatics analysis of HOXA5 gene in Que' shan black pigs |
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| DUAN Dongdong,LI Cong,LI Mengyu,LI Xin,WANG Kejun,LI Xiuling,HAN Xuelei,QIAO Ruimin,LI Xinjian.Tissue expression and bioinformatics analysis of HOXA5 gene in Que' shan black pigs[J].Journal of Henan Agricultural University,2022,56(2):281-289. |
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| Authors: | DUAN Dongdong LI Cong LI Mengyu LI Xin WANG Kejun LI Xiuling HAN Xuelei QIAO Ruimin LI Xinjian |
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