我国部分地区禽流感病毒流行株的分子流行病学调查

为了解近年来禽流感病毒在我国部分地区家禽中的流行情况,深入阐明我国禽流感病毒流行株的HA和NP基因的进化关系及遗传进化过程,本研究采用RT-PCR方法,对我国广西、河北、湖南、河南、山东等地采集的病料进行检测,并对其中19株H5N1阳性分离株进行HA和NP基因测序,将测定的序列与参照序列对比,运用DNAStar软件对核苷酸序列进行同源性和遗传进化分析。结果表明,分离的禽流感流行株因地域的不同、时间的差异、宿主的不同,禽流感病毒HA基因核苷酸序列的同源性在96.0%⁹9.7%之间,推导的氨基酸序列的同源性在95.8%99.7%之间,推导的氨基酸序列的同源性在95.8%⁹9.6%之间;禽流感病毒NP基因核苷酸序列的同源性在68.2%99.6%之间;禽流感病毒NP基因核苷酸序列的同源性在68.2%⁹9.7%之间,推导的氨基酸序列的同源性在65.5%99.7%之间,推导的氨基酸序列的同源性在65.5%⁹9.8%之间。各分离株在遗传进化树上并不集中处于一个分枝中,而是处于遗传进化树的不同位置,说明我国禽流感病毒可能已经发生部分变异,这些禽流感病毒起源于不同的种系,但可能具有共同的祖先。

Molecular Epidemiology of AIV epidemic strains form parts of China