| 辣椒转录组SSR挖掘及其多态性分析 |
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| 引用本文： | 刘峰,王运生,田雪亮,茆振川,邹学校,谢丙炎.辣椒转录组SSR挖掘及其多态性分析[J].园艺学报,2012,39(1):168-172. |
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| 作者姓名： | 刘峰 王运生 田雪亮 茆振川 邹学校 谢丙炎 |
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| 作者单位： | （1湖南省农业科学院蔬菜研究所，长沙410125；2湖南农业大学生物安全科学技术学院，长沙410128；3中国农业科学院蔬菜花卉研究所，北京100081；4河南科技学院，河南新乡453003） |
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| 基金项目： | 国家重点基础发展计划项目，国家自然科学基金项目，国家大宗蔬菜产业技术体系项目，公益性行业(农业)科研专项 |
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| 摘 要： | 利用SSR检索程序从两个辣椒转录组共221 037条unigenes（97.3 Mb）中筛选得到17 319个SSR位点（7.83%），其发生频率为1/56 kb。其中以单核苷重复基序为主导类型，占总SSR的56.30%；其次是二、三核苷酸重复基序，其出现频率分别为19.16%和23.18%。对所有含SSR位点EST序列设计的10 468对引物进行E-PCR多态性检测，获得1 538对E-PCR多态性引物。随机选取20对引物进行验证，其中7对（36.84%）在10个不同类型辣椒材料中表现出多态性，PIC值范围为0.33 ~ 0.89，平均为0.67，将10个辣椒材料分为3类。这些潜在的多态性EST-SSR的开发为辣椒遗传多样性分析、图谱构建提供了更丰富的候选分子标记。
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| 关 键 词： | 辣椒 转录组 EST-SSR |
| 收稿时间： | 2011-11-11 |
| 修稿时间： | 2011-12-21 |
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