| 梅山猪氨肽酶基因N(pAPN)cDNA克隆、序列分析及重要变异位点的筛选 |
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| 引用本文： | 刘颖,董文华,孙寿永,吴正常,夏芃芃,朱国强,包文斌,吴圣龙.梅山猪氨肽酶基因N(pAPN)cDNA克隆、序列分析及重要变异位点的筛选[J].农业生物技术学报,2014,22(9). |
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| 作者姓名： | 刘颖 董文华 孙寿永 吴正常 夏芃芃 朱国强 包文斌 吴圣龙 |
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| 作者单位： | 1. 扬州大学动物科学与技术学院/江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室,扬州,225009
2. 扬州大学兽医学院,扬州,225009 |
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| 基金项目： | 国家转基因生物新品种培育科技重大专项，江苏省科技支撑计划(农业)，江苏省产学研前瞻性联合研究项目 |
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| 摘 要： | 氨肽酶N(aminopeptidase N,APN)蛋白是猪(Sus scrofa)传染性胃肠炎病毒(Transmissible gastroenteritis virus,TGEV)和猪的流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)等一系列冠状病毒的受体蛋白。为探讨梅山猪APN基因的分子结构特征以及重要的变异位点,本研究通过PCR扩增和测序技术,结合生物信息学分析梅山猪APN基因功能区域和重要变异位点,对其蛋白质结构进行预测和分析。结果表明,梅山猪APN基因cDNA全长2 886 bp(GenBank登录号:KF280271),含有20个外显子,编码961个氨基酸。与GenBank数据库公布的标准序列(登录号:NM_214277.1)相比,梅山猪APN基因编码区变异共引起10处氨基酸突变与2处氨基酸缺失,其中Phe82Asn、Leu107Phe、Leu108 Ile、Ser330Pro、Trp399Arg和Glu465 Gly等6处突变位于APN酶催化活性区域,Gln747His突变、748Tyr和749Ser缺失突变位于APN病毒结合区域。蛋白结构和编码产物功能分析发现,pAPN为不稳定的亲水性蛋白,无信号肽,具有1个跨膜螺旋(跨膜区位于12~34氨基酸,二级结构元件以α螺旋和β折叠为主,编码产物主要参与细胞被膜(cell envelope)、中央中间代谢(central intermediary metabolism)、辅酶因子生物合成(biosynthesis of cofactors)等功能。Gln747His、748Tyr和749Ser缺失突变可能与氨肽酶N结合病毒能力有关。本研究对梅山猪pAPN基因功能的分析及变异位点的筛选,为今后筛选猪抗病毒性腹泻的有效遗传标记提供理论基础。
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| 关 键 词： | 猪 流行性腹泻 氨肽酶N基因(APN) 变异位点 |
Cloning and Screening of Important Mutation Loci of Aminopeptidase N Gene (pAPN) in Meishan Pigs (Sus scrofa) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Pigs Epidemic diarrhea Aminopeptidase N gene(APN) Mutation loci |
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