抗逆性转录因子NAC的生物信息学分析 |
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引用本文: | 康美玲,周振华,田忠景,明东风,马丽.抗逆性转录因子NAC的生物信息学分析[J].湖北农业科学,2014,53(17):4199-4204. |
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作者姓名: | 康美玲 周振华 田忠景 明东风 马丽 |
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作者单位: | 枣庄学院生命科学学院,山东枣庄,277160 |
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基金项目: | 枣庄学院博士科研基金项目 |
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摘 要: | 根据在NCBI中已登录的植物转录因子NAC家族中与抗逆性有关成员的核苷酸序列和氨基酸序列,应用生物信息学软件分析了其理化性质、疏水性/亲水性、跨膜结构、二级结构、功能结构域等,并构建了这类NAC家族成员的系统进化树.结果表明,17种NAC成员的蛋白质一级结构中存在明显的疏水区和亲水区,都存在明显的α--螺旋和β折叠.二级结构组成上相似,都由α-螺旋、β折叠和无规则卷曲组成.这些成员都能够通过同源建模分析NAC蛋白质的三维结构.进化分析表明,它们主要分成4大类群.通过多序列比对得到了这些成员的保守区段,并设计了简并引物.
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关 键 词: | 转录因子 NAC 生物信息学分析 抗逆性 |
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