| 利用集群分离分析结合高密度芯片快速定位小麦成株期抗条锈病基因YrC271 |
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| 引用本文： | 刘丹,周彩娥,王晓婷,吴启蒙,张旭,王琪琳,曾庆东,康振生,韩德俊,吴建辉.利用集群分离分析结合高密度芯片快速定位小麦成株期抗条锈病基因YrC271[J].作物学报,2022(3):553-564. |
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| 作者姓名： | 刘丹 周彩娥 王晓婷 吴启蒙 张旭 王琪琳 曾庆东 康振生 韩德俊 吴建辉 |
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| 作者单位： | 西北农林科技大学农学院/旱区作物逆境生物学国家重点实验室;西北农林科技大学植物保护学院/旱区作物逆境生物学国家重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31901494,31901869,31971890)资助。 |
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| 摘 要： | 由国际玉米小麦改良中心(CIMMYT)培育的春小麦高代选系C271对小麦条锈病保持抗性近40年。为明确C271的抗条锈病遗传组分,利用感病品种晋麦79与C271杂交构建含有229个F2:3家系的遗传群体,并于2019年在陕西杨凌和四川江油进行成株期病害调查。运用集群分离分析(BSA)结合高密度660K芯片策略在3B染色体短臂上快速挖掘出大量的与抗病关联的SNP,利用等位基因特异的定量PCR标记(AQP)进行验证并作图,成功检测到一个效应值较大的QTL,可解释表型变异为22.7%～30.8%,暂命名为YrC271,位于标记AX-109001377和AX-111087256之间,约1.9cM,对应的物理距离1.9Mb。利用已公布的小麦基因组信息对该区间进行比较基因组分析,结果表明,与中国春基因组相比,不同材料间存在小片段的插入以及倒位现象,但总体共线性良好。同时利用1484份小麦660K分型数据对该区间进行单倍型分析,总体可分为5种区间单倍型,其中C271所在的单倍型组的抗性优于其他组。虽然C271不含有Yr30和Yr58连锁标记的阳性片段,但从相对遗传位置、条锈病抗性表现以及育种系谱看,...
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| 关 键 词： | 条锈病成株抗性 YrC271 SNP标记 比较基因组分析 单倍型分析 |
Rapid identification of adult plant wheat stripe rust resistance gene YrC271 using high-throughput SNP array-based bulked segregant analysis |
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| LIU Dan,ZHOU Cai-E,WANG Xiao-Ting,WU Qi-Meng,ZHANG Xu,WANG Qi-Lin,ZENG Qing-Dong,KANG Zhen-Sheng,HAN De-Jun,WU Jian-Hui.Rapid identification of adult plant wheat stripe rust resistance gene YrC271 using high-throughput SNP array-based bulked segregant analysis[J].Acta Agronomica Sinica,2022(3):553-564. |
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| Authors: | LIU Dan ZHOU Cai-E WANG Xiao-Ting WU Qi-Meng ZHANG Xu WANG Qi-Lin ZENG Qing-Dong KANG Zhen-Sheng HAN De-Jun WU Jian-Hui |
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| Institution: | (State Key Laboratory of Crop Stress Biology for Arid Areas,College of Agronomy,Northwest A&F University,Yangling 712100,Shaanxi,China;State Key Laboratory of Crop Stress Biology for Arid Areas,Plant Protection,Northwest A&F University,Yangling 712100,Shaanxi,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | adult plant resistance to stripe rust YrC271 SNP markers comparative genomics analysis haplotype analysis |
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