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拟南芥 START 结构域亚家族生物信息学分析及功能
作者姓名:李晓凯  刘霞  常红娟  王凤茹
作者单位:河北省植物生理与分子病理学重点实验室/河北农业大学真菌毒素与植物分子病理学实验室,河北 保定 071000
基金项目:河北省自然科学基金项目(C2019304421);;河北省高等学校科学技术研究项目((ZD2018085);
摘    要:START(The Steroidogenic Acute Regulatory Protein-related Lipid Transfer)结构域广泛存在于动物和植物中,参与脂质分子的转移,发挥多种生物学功能。为明确拟南芥START结构域家族成员的结构特征及功能机制,本研究以拟南芥START结构域亚家族为研究对象,通过生物信息学对该家族成员的进化关系、理化性质、基因结构、启动子顺式作用元件进行分析比较,在此基础上,通过qRT-PCR技术,对仅含START结构域亚家族成员在拟南芥发育不同组织表达特性进行了分析,通过分析仅含START结构域亚家族成员的功能获得和功能缺失的转基因拟南芥幼苗形态,确定该亚家族成员对拟南芥幼苗生长的调控作用。结果发现,拟南芥START结构域家族共有35个成员,仅含START结构域亚家族9个成员,但在进化树分析中At4g26920和At5g07260与其余7个成员不在同一分枝中,且其疏水性结合位点不同。仅含START结构域亚家族成员中仅有At3g23080不稳定系数小于40,较为稳定,多数成员均为不稳定蛋白质。基因表达分析表明仅含START结构域亚家族成员具有...

关 键 词:拟南芥  START结构域  生物信息学分析  生长发育
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