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小麦淀粉合酶基因家族成员的表达差异分析
引用本文:王谢琴,李瑞雪,张 红,陈 娇,于小蓉,刘汉梅.小麦淀粉合酶基因家族成员的表达差异分析[J].麦类作物学报,2022(8):938-947.
作者姓名:王谢琴  李瑞雪  张 红  陈 娇  于小蓉  刘汉梅
作者单位:(四川农业大学生命科学学院,四川雅安 625000)
基金项目:国家自然科学基金项目(31601317)
摘    要:籽粒淀粉的含量和结构影响小麦的产量和品质,而淀粉合酶在淀粉合成中起着关键作用。植物淀粉合酶基因经多次复制和功能分化,形成了具有不同功能特性的多成员大家族。为揭示淀粉合酶基因家族成员间的序列特性和表达差异,本研究参考已知的水稻淀粉合酶蛋白序列,对小麦全基因组中的淀粉合酶基因进行鉴定,并对其进行差异表达分析。结果共鉴定到27个小麦淀粉合酶基因,这些基因分布在1A/1B/1D、2A/2B/2D、6A/6B/6D、7A/7B/7D染色体上,可分为Group A和Group B两大类,Group A包含TaGBSS TaSSⅠ TaSSⅡ三个亚家族,所编码的蛋白均具有motif1~motif10,且motif排列顺序一致;Group B包含 TaSSⅢ TaSSⅣ两个亚家族,所编码的蛋白都缺少motif9和motif10,另外 TaSSⅢ亚家族还缺少motif8。与玉米、水稻、高粱、拟南芥不同,小麦淀粉合酶基因没有 TaSSⅤ亚家族。同一亚家族内不同基因具有明显的表达差异,其中, TaGBSSⅠ TaSSⅡa TaSSⅢa在胚乳中特异表达;小麦相同部分同源群内的淀粉合酶基因间在不同组织和不同发育时期也存在表达差异, TaSSⅡa-B TaSSⅡa-D在授粉后20 d和30 d的胚乳中表达量比 TaSSⅡa-A高。差异表达的淀粉合酶基因启动子中的胚乳特异表达元件(RY-element、AACA-motif和ACGTOSGLUB1)存在类型和数量差异。

关 键 词:小麦  淀粉合酶  基因家族  表达差异  顺势作用元件

Expression Differentiation of Starch Synthase Gene Family Members in Wheat
WANG Xieqin,LI Ruixue,ZHANG Hong,CHEN Jiao,YU Xiaorong,LIU Hanmei.Expression Differentiation of Starch Synthase Gene Family Members in Wheat[J].Journal of Triticeae Crops,2022(8):938-947.
Authors:WANG Xieqin  LI Ruixue  ZHANG Hong  CHEN Jiao  YU Xiaorong  LIU Hanmei
Abstract:
Keywords:Triticum aestivum  Starch synthase  Gene family  Expression differentiation  Cis-acting element
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