辣椒WRKY转录因子的鉴别及进化分析 |
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引用本文: | 刁卫平,王述彬,刘金兵,潘宝贵,郭广君,戈伟.辣椒WRKY转录因子的鉴别及进化分析[J].华北农学报,2014(6). |
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作者姓名: | 刁卫平 王述彬 刘金兵 潘宝贵 郭广君 戈伟 |
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作者单位: | 江苏省农业科学院 蔬菜研究所,江苏 南京,210014 |
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基金项目: | 国家高技术研究发展计划(“863”计划)项目,现代农业产业技术体系建设专项基金项目,江苏省农业科技自主创新基金项目(CX |
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摘 要: | 为了深入了解WRKY转录因子调节植物生长发育的过程,以辣椒全基因组和辣椒疫病转录组测序数据为材料,利用生物信息学方法分析辣椒WRKY转录因子的数目、种类、系统发生学和保守基序特征。结果表明,辣椒基因组中至少存在40个WRKY基因,包含1~2个WRKY保守结构域,根据WRKY结构域的数量及锌指结构的特征可将其分为Ⅰ、Ⅱ( a)、Ⅱ( b)、Ⅱ( c)、Ⅱ( d)、Ⅱ( e)和Ⅲ类/亚类。辣椒WRKY基因的保守motif共有3个,motif长度最长为50,最短为21,辣椒WRKY编码的蛋白为151~747个氨基酸,平均氨基酸数量为378.1个。该研究对辣椒WRKY基因功能的研究及进化具有重要的意义。
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关 键 词: | 辣椒 WRKY 转录因子 生物信息学 |
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