番茄种子RNA提取及快速检测qRT-PCR模板纯度的方法优化 |
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引用本文: | 杨荣超,章月琴,丰锋,丁小明,齐飞.番茄种子RNA提取及快速检测qRT-PCR模板纯度的方法优化[J].种子,2016(5). |
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作者姓名: | 杨荣超 章月琴 丰锋 丁小明 齐飞 |
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作者单位: | 1. 广东海洋大学农学院,广东湛江,524088;2. 农业部规划设计研究院设施农业研究所,北京,100026 |
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基金项目: | 设施节能与绿色能源利用研制与产业化示范(2014BAD08B02) |
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摘 要: | 番茄种子内富含多糖、贮藏蛋白、脂肪,同时还含有酚、酮等多种次生代谢物质,给提取高质量的RNA进行基因表达相关研究带来了的困难.本研究通过优化北京华越洋生物科技有限公司RNA提取试剂盒的操作流程,获得大量完整的RNA,并通过设计跨越内参基因(EF1α)内含子的引物鉴定DNA的污染.结果表明,以水和RNA为模板没有扩增出片段,以种子DNA为模板扩增出包含内含子的441 bp DNA片段,以cDNA为模板扩增出363 bp的DNA片段,这说明cDNA没有被DNA污染.利用这种策略分析了种子萌发过程中2个基因的表达水平,基因表达结果证明了这是一种快速、有效的方法.另外,这种策略为植物转录组学的相关研究提供了参考方法.
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关 键 词: | 荧光定量PCR 纯度检测 基因表达 |
The Optimization Method on RNA Extraction of Tomato Seed and Rapid Detection of Purity for qRT-PCR Template |
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Abstract: | |
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Keywords: | real time RT-qPCR detection of purity gene expression |
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