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番茄种子RNA提取及快速检测qRT-PCR模板纯度的方法优化
引用本文:杨荣超,章月琴,丰锋,丁小明,齐飞.番茄种子RNA提取及快速检测qRT-PCR模板纯度的方法优化[J].种子,2016(5).
作者姓名:杨荣超  章月琴  丰锋  丁小明  齐飞
作者单位:1. 广东海洋大学农学院,广东湛江,524088;2. 农业部规划设计研究院设施农业研究所,北京,100026
基金项目:设施节能与绿色能源利用研制与产业化示范(2014BAD08B02)
摘    要:番茄种子内富含多糖、贮藏蛋白、脂肪,同时还含有酚、酮等多种次生代谢物质,给提取高质量的RNA进行基因表达相关研究带来了的困难.本研究通过优化北京华越洋生物科技有限公司RNA提取试剂盒的操作流程,获得大量完整的RNA,并通过设计跨越内参基因(EF1α)内含子的引物鉴定DNA的污染.结果表明,以水和RNA为模板没有扩增出片段,以种子DNA为模板扩增出包含内含子的441 bp DNA片段,以cDNA为模板扩增出363 bp的DNA片段,这说明cDNA没有被DNA污染.利用这种策略分析了种子萌发过程中2个基因的表达水平,基因表达结果证明了这是一种快速、有效的方法.另外,这种策略为植物转录组学的相关研究提供了参考方法.

关 键 词:荧光定量PCR  纯度检测  基因表达

The Optimization Method on RNA Extraction of Tomato Seed and Rapid Detection of Purity for qRT-PCR Template
Abstract:
Keywords:real time RT-qPCR  detection of purity  gene expression
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