| 玉米雌穗产量相关性状全基因组关联分析与候选基因鉴定 |
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| 引用本文： | 殷芳冰,李雅楠,鲍建喜,马雅杰,秦文萱,王锐璞,龙艳,李金萍,董振营,万向元.玉米雌穗产量相关性状全基因组关联分析与候选基因鉴定[J].作物学报,2023(2):377-391. |
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| 作者姓名： | 殷芳冰 李雅楠 鲍建喜 马雅杰 秦文萱 王锐璞 龙艳 李金萍 董振营 万向元 |
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| 作者单位： | 1. 北京科技大学生物与农业研究中心/化学与生物工程学院/顺德研究生院/北京中智生物农业国际研究院 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划项目“农业生物种质资源挖掘与创新利用”重点专项(2021YFD1200700)资助~~； |
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| 摘 要： | 玉米雌穗产量相关性状直接影响玉米最终产量,解析其遗传机制可为玉米高产提供有益指导。本研究以733份玉米自交系作为关联群体,在2个环境下随机区组种植,调查穗行数(KRN)、穗长(EL)和穗粗(ED) 3个产量相关性状,利用MaizeSNP3072芯片对其进行基因分型,采用FarmCPU模型进行全基因组关联分析,分别鉴定出16、13和24个与3个性状显著关联的单核苷酸多态性位点(SNP),对表型变异的解释率分别为0.01%～7.08%、0.01%～5.34%和0.07%～4.34%。其中,分别有6、2和5个与3个性状存在显著关联的高可信度(highconfidence,HC)SNP,而且有2个HC-SNP同时与KRN和ED显著相关, 1个KRN HC-SNP和3个ED HC-SNP为本研究首次报道。在所鉴定HC-SNP上下游200 kb范围内筛选出33个重要候选基因,其中9号染色体SNP标记PZE-109003046所在基因PIN1a为控制生长素极性运输从而调控雌穗性状的已知基因。另一些候选基因编码不同转录因子,以及参与生长素、赤霉素和乙烯等激素介导的信号转导、DNA甲基化和蛋白磷酸化等翻...
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| 关 键 词： | 玉米 雌穗产量相关性状 全基因组关联分析 候选基因 |
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