| 水稻黑条矮缩病毒基因组片段S10的cDNA克隆及全序列分析 |
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| 引用本文： | 张恒木,陈剑平,薛庆中,雷娟利.水稻黑条矮缩病毒基因组片段S10的cDNA克隆及全序列分析[J].中国水稻科学,2002,16(1):24-28. |
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| 作者姓名： | 张恒木 陈剑平 薛庆中 雷娟利 |
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| 作者单位： | 1.浙江大学 农业与生物技术学院， 浙江 杭州 310029； 2 浙江省农业科学院 病毒学实验室， 浙江 杭州 310021； * 通讯联系人，E-mail:jpchen@mail.hz.zj.cn |
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| 基金项目： | 浙江省科技厅重点实验室专项经费资助项目，浙江省青年人才专项基金资助项目 ( RC96 0 4) |
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| 摘 要： | 基于RT-PCR策略克隆了水稻黑条矮缩病毒（rice black streaked dwarf virus，RBSDV）浙江分离株基因组S10，并测定了它的全序列。结果表明，水稻黑条矮缩病毒浙江分离物（RBSDV-Zj）基因组片段S10全长1801 nt（EMBL登录号为AJ297433），仅含有一个大的开放阅读框（open reading frame，ORF），编码一个63.1 kD的多肽，与日本的水稻黑条矮缩病毒基因组片段S10在核苷酸和氨基酸水平上同源性分别为93.8%和96.2%；与意大利玉米粗缩病毒（maize rough dwarf virus，MRDV）的基因组片段S10在核苷酸和氨基酸水平上的同源性分别为87.7%和92.0%，推测它们是同一病毒的不同地理小种。
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| 关 键 词： | 水稻黑条矮缩病毒 基因组片段 |
| 文章编号： | 1001-7216(2002)01-0024-05 |
| 收稿时间： | 1900-01-01; |
cDNA Cloning and Sequence Analysis of Genome Segment S10 from Rice Black-Streaked Dwarf Virus |
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| ZHANG Heng-mu ,CHEN Jian-ping ,XUE Qing-zhong ,LEI Juan-li.cDNA Cloning and Sequence Analysis of Genome Segment S10 from Rice Black-Streaked Dwarf Virus[J].Chinese Journal of Rice Science,2002,16(1):24-28. |
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| Authors: | ZHANG Heng-mu CHEN Jian-ping XUE Qing-zhong LEI Juan-li |
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| Institution: | (;1. College of Agriculture and Biotechnology; Zhejiang University; Hangzhou 310029; China;2.Virology Laboratory; Zhejiang Academy of Agricultural Sciences; Hangzhou 310021) |
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| Abstract: | Genome segment S10 of a Zhejiang isolate of rice black-streaked dwarf virus (RBSDV-Zj) was amplified by RT-PCR and sequenced. It consisted of 1801 nt (EMBL accession number is AJ297433) with only one open reading frame which encodes a polypeptide with molecular weight of 63.1 kD. Sequence comparison showed 93.8% and 96.2% homology at level of nucleotide and amino acid sequences between RBSDV-Zj and Japanese isolate (RBSDV-Jap), respectively;and shared 87.1% and 92.0% homology at level of nucleotide and acid sequences between RBSDV-Zj and Italian MRDV, respectively. |
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| Keywords: | rice black-streaked dwarf virus genome segment sequence analysis |
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