氮素诱导的甜菜gln2的克隆及序列分析 |
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引用本文: | 陈胜勇,李彩凤,侯静,马凤鸣,李观康,何霭如,余小丽,汪云.氮素诱导的甜菜gln2的克隆及序列分析[J].核农学报,2014(10). |
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作者姓名: | 陈胜勇 李彩凤 侯静 马凤鸣 李观康 何霭如 余小丽 汪云 |
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作者单位: | 东北农业大学农学院;广东省湛江市农业科学研究院;中国农业大学农学与生物技术学院; |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(30471017,30771276);现代农业产业技术体系建设专项经费项目(CARS-11-C-18) |
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摘 要: | 本文探索了在氮素诱导下,甜菜gln2序列变化情况及氮素对gln2的调控表达情况。根据已知甜菜谷氨酰胺合成酶基因(gln2,登录号为AY026353)设计特异引物,利用RT-PCR方法克隆甜菜质体型谷氨酰胺合成酶的cDNA(GS2 cDNA)片段和甜菜质体型谷氨酰胺合成酶基因组DNA(GS2 DNA)序列,并进行生物信息学分析。获得甜菜GS2 cDNA片段序列,并首次得到甜菜GS2 DNA序列,并将GS2DNA登录到了NCBI网站的GenBank(登录号为EU558132)。生物信息学分析结果表明,GS2 DNA长度为6 144bp,含有13个外显子和12个内含子;氮素诱导的GS2 cDNA序列长度为1 296bp,与gln2序列相似性达99.92%,可编码431个氨基酸残基;其氨基酸序列与其它植物的质体型谷氨酰胺合成酶(GS2)有很高的同源性,与菠菜GS2的同源性最高,属于混合型蛋白,具有Gln-synt保守功能域,N端为beta-Grasp domain,C端为catalytic domain。采用半定量PCR分析该基因在氮素处理下的诱导表达情况,结果表明,NO3-N∶NH4+-N=80∶20和NO3-N∶NH4+-N=50∶50的处理对GS2基因表达的促进效果最好,NO3-N∶NH4+-N=0∶100对GS基因诱导作用最差。研究甜菜GS基因的结构功能及表达调控对甜菜实现高同化氨及增产增糖有重要意义。
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关 键 词: | 甜菜 质体型谷氨酰胺合成酶(gln) 基因克隆 序列分析 表达谱 |
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