马铃薯可溶性淀粉合成酶SSⅢ基因克隆及生物信息学分析 |
| |
作者姓名: | 杨涛 张宁 栗亮 刘海英 司怀军 王蒂 |
| |
作者单位: | 1. 甘肃农业大学生命科学技术学院,兰州,730070;甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室,兰州,730070 2. 甘肃农业大学生命科学技术学院,兰州,730070 3. 甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室,兰州,730070;甘肃农业大学农学院,兰州,730070 4. 内蒙古乌兰察布职业学院马铃薯工程系,乌兰察布,012000 |
| |
基金项目: | 国家高技术研究发展计划(863计划),甘肃省农业生物技术研究与应用开发项目 |
| |
摘 要: | 用RT-PCR方法从马铃薯中克隆了可溶性淀粉合成酶SSⅢ基因的cDNA片段,序列分析表明该cDNA片段全长为3 967 bp,开放阅读框为3 693 bp,编码1 230个氨基酸.核酸序列同源性分析表明,该cDNA与已发表的马铃薯SSⅢ基因(X94400)具有99%同源性,氨基酸序列同源性达98%.应用生物信息学软件对SSⅢ基因分析表明:其编码的蛋白质具有多个磷酸化位点;蛋白质二级结构预测显示,有369个氨基酸可能形成α-螺旋结构,249个氨基酸可能形成β折叠,102个氨基酸可能形成β转角,510个氨基酸可能形成无规则卷曲;通过亚细胞定位可知,它是一种含有75个氨基酸的叶绿体转运肽蛋白.
|
关 键 词: | 马铃薯 SSⅢ基因 克隆 生物信息学 |
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录! |
|