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乌药ISSR扩增条件的优化
引用本文:顾婧婧,金则新,李钧敏,李建辉,毕泉鑫.乌药ISSR扩增条件的优化[J].西北林学院学报,2008,23(6).
作者姓名:顾婧婧  金则新  李钧敏  李建辉  毕泉鑫
作者单位:1. 西南大学,三峡库区生态环境教育部重点实验室,重庆,北碚,400715;台州学院生态研究所,浙江,临海,317000
2. 台州学院生态研究所,浙江,临海,317000
摘    要:为了确保ISSR分析的可靠性和重复性,有必要进行ISSR-PCR反应体系的优化.以浙江省天台山乌药(Lindera aggregata)自然种群随机个体的基因组DNA为研究对象,通过对反应体系中的Mg2 浓度、dNTP浓度、模板DNA用量、Taq DNA聚合酶用量、BSA浓度、引物用量进行筛选和优化,得出了适用于乌药ISSR分析的扩增条件:10μL PCR反应体积,1×Taq酶配套缓冲液(200 mmol·L-1 Tris·HCl,PH 8.8,100 mmol·L-1 KCl,1%Triton X-100,100 mmol·L-1(NH4)42S04,20 mmol.L-1MgCl2),0.5U Taq DNA聚合酶,10 ng模板DNA,10 pmol引物,0.4mmol.L-1dNTP.利用优化反应体系从100个ISSR引物中筛选出12个重复性好、稳定性高的引物对20个乌药个体的DNA进行扩增,共得到142个位点,其中,102个为多态位点,多态位点百分率为71.83%,Nei指数为0.284 3,Shannon信息指数为0.415 3,乌药的遗传多样性处于较高水平.

关 键 词:乌药  优化  遗传多样性

Optimization of the ISSR Conditions in Lindera aggregata
GU Jing-jing,JIN Ze-xin,LI Jun-min,LI Jian-hui,BI Quan-xin.Optimization of the ISSR Conditions in Lindera aggregata[J].Journal of Northwest Forestry University,2008,23(6).
Authors:GU Jing-jing  JIN Ze-xin  LI Jun-min  LI Jian-hui  BI Quan-xin
Abstract:
Keywords:ISSR
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