红肉火龙果TST基因家族的生物信息学分析

为分离参与红肉火龙果果实可溶性糖积累的功能基因，基于转录组测序数据克隆液泡糖转运蛋白（Tonoplast sugar transporter，TST）基因家族，进行序列同源性、跨膜结构、亚细胞定位和系统发育等生物信息学分析。结果表明：红肉火龙果含有4个TST基因，开放读码框（open reading frame，ORF）长度为2 127～2 235 bp，编码长度为708～744 个氨基酸的序列。预测等电点为4.84～5.36，相对分子量为75.7～80.4 kDa；红肉火龙果TST家族氨基酸序列与甜菜和藜麦TST家族具有74.9%～83.4%的相似性；红肉火龙果TST成员均含11～12个跨膜结构域，定位于质体、叶绿体、液泡或内质网等细胞器。系统进化分析表明HpTST1属于TST1类，HpTST2.1和HpTST2.2属于TST2类，HpTST3属于TST3类。