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关岭牛解偶联蛋白3基因5’侧翼区克隆和生物信息学分析
引用本文:陈伟,许厚强,刘忠伟,陈祥,张雯,桓聪聪.关岭牛解偶联蛋白3基因5’侧翼区克隆和生物信息学分析[J].中国畜牧兽医,2014,41(9):6-10.
作者姓名:陈伟  许厚强  刘忠伟  陈祥  张雯  桓聪聪
作者单位:1. 贵州大学动物科学学院, 贵州贵阳 550025;
2. 贵州大学, 高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部 重点实验室, 贵州贵阳 550025;
3. 贵州大学生命科学学院, 贵州贵阳 550025
基金项目:国家转基因生物新品种培育科技重大专项(2011ZX08009-004);贵州省科技厅农业攻关计划(黔科NY字[2012]3008号);贵州省科学技术基金项目(黔科合J字[2012]2145号)。
摘    要:本试验对贵州关岭牛解偶联蛋白3(uncoupling protein,UCP3)基因5'侧翼区进行克隆,并利用生物信息学软件对其1080 bp的克隆序列进行分析,以研究UCP3基因5'侧翼区特异性转录调控元件的调控机制。软件分析发现关岭牛UCP3基因5'侧翼区含有6个可能的转录起始点和33个潜在转录因子结合位点,与东北虎、家猫、印度水牛、藏羚羊、山羊、绵羊UCP3基因5'侧翼区(-196~+100 bp)序列相似性分别为82%、82%、98%、95%、96%和98%;该区域保守性较强,推测转录起始点上游-200~+1 bp可能是其核心启动子区域,该区域在调控基因转录和翻译方面具有共同的作用。试验成功克隆了UCP3基因5'侧翼区序列1080 bp,初步预测了该基因的核心启动子区。

关 键 词:关岭牛  解偶联蛋白3基因  启动子  转录因子  

Cloning and Sequence Analysis of UCP3 Gene 5’-Flanking Region of Guanling Cattle
CHEN Wei,XU Hou-qiang,LIU Zhong-wei,CHEN Xiang,ZHANG Wen,HUAN Cong-cong.Cloning and Sequence Analysis of UCP3 Gene 5’-Flanking Region of Guanling Cattle[J].China Animal Husbandry & Veterinary Medicine,2014,41(9):6-10.
Authors:CHEN Wei  XU Hou-qiang  LIU Zhong-wei  CHEN Xiang  ZHANG Wen  HUAN Cong-cong
Institution:1. College of Animal Science, Guizhou University, Guiyang 550025, China;
2. Key Laboratory of Animal Genetics, Breeding and Reproduction in the Plateau Mountainous Region, Guizhou University, Guiyang 550025, China;
3. College of Life Science, Guizhou University, Guiyang 550025, China
Abstract:
Keywords:
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