湖羊和巴什拜羊BMP15基因c.-1760C>A变异与启动子区活性的关系 |
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引用本文: | 金雯雯,王德迪,潘增祥,决肯,李齐发.湖羊和巴什拜羊BMP15基因c.-1760C>A变异与启动子区活性的关系[J].南京农业大学学报,2016(4):632-639. |
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作者姓名: | 金雯雯 王德迪 潘增祥 决肯 李齐发 |
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作者单位: | 南京农业大学动物科技学院;新疆农业大学动物科学学院 |
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基金项目: | 江苏省自然科学基金项目(BK20141369);江苏省农业科技自主创新资金项目(CX(15)1007) |
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摘 要: | 目的]为了解湖羊和巴什拜羊骨形态发生蛋白15(BMP15)基因编码区和5'调控区(5'UTR)序列特征与差异,检测其SNPs(single nucleotide polymorphisms)并探索其功能。方法]利用克隆测序技术获得湖羊和巴什拜羊BMP15基因编码区和5'UTR序列,运用生物信息学方法分析其序列特征;采用DNA池测序法筛选湖羊和巴什拜羊BMP15基因SNPs,直接测序法检测SNPs位点多态性;采用荧光素酶报告基因系统检测启动子区活性。结果]湖羊和巴什拜羊BMP15基因编码区序列长度均为1 182 bp,编码393个氨基酸,编码蛋白含有典型的TGF-β结构域;湖羊和巴什拜羊BMP15基因编码区序列的同源性为99.92%,发现1个SNP位点。获得1 806 bp湖羊和巴什拜羊BMP15基因5'调控区序列,发现5个SNPs位点。BMP15基因c.-1760CA位点多态性分析发现湖羊群体中均为CC基因型,巴什拜羊群体中有CC、CA和AA 3种基因型,等位基因C和A频率分别为0.798 1和0.201 9。启动子区活性检测显示CC型启动子区活性明显高于AA型。结论]湖羊和巴什拜羊BMP15基因编码区序列高度保守,c.-1760CA变异可能影响BMP15基因启动子区活性。
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关 键 词: | BMP15基因 湖羊 巴什拜羊 SNPs 启动子区活性 |
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