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香蕉漆酶基因家族鉴定及低温胁迫下的表达分析
引用本文:刘彦英,倪珊珊,项蕾蕾,陈裕坤,赖钟雄.香蕉漆酶基因家族鉴定及低温胁迫下的表达分析[J].园艺学报,2020,36(5):837-852.
作者姓名:刘彦英  倪珊珊  项蕾蕾  陈裕坤  赖钟雄
作者单位:福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福州 350002
基金项目:国家重点研发计划项目(2019YFD1000901);国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目(GARS-31-15);福建省高原学科建设经费项目(102/71201801101);福建农林大学科技创新专项基金项目(KF2015108,CXZX2013119,CXZX2017351,CXZX2017189,CXZX2018076)
摘    要:为研究香蕉漆酶基因家族成员的功能,采用生物信息学方法鉴定香蕉漆酶基因成员,分析其低温胁迫下的表达情况,为香蕉抗寒研究提供理论依据。从香蕉A(Musa acuminata)基因组筛选了22条漆酶基因(MaLAC),从香蕉B(Musa balbisiana)基因组筛选了11条漆酶基因(MbLAC),通过生物信息分析发现MaLAC比MbLAC更保守。分子进化树分析结果表明MaLAC可分为5类,MbLAC可分为4类。启动子顺式作用元件分析结果表明,MaLAC启动子序列包含大量光响应、激素应答及非生物胁迫等应激响应元件,推测MaLAC基因家族在响应逆境胁迫的过程中发挥重要作用。利用qRT-PCR技术对MaLAC部分成员在响应不同低温胁迫的表达情况进行分析,MaLAC3-2、MaLAC4、MaLAC4-5、MaLAC17在低温(13、4、0 ℃)处理下表达量均极显著高于对照(28 ℃),推测可能在香蕉响应低温胁迫的过程中发挥重要作用。预测香蕉MaLAC家族有18个成员受miRNA调控,主要受miR397和miR408的调控;推测香蕉MaLAC可能参与miRNA调控途径。

关 键 词:香蕉  漆酶家族  成员鉴定  生物信息分析  低温胁迫  

Lipopolysaccharide exposure during gestation activates microglia to induce autism-like behavior in offspring of rats
FENG Di,CHEN Bao-lin,XIAO Lu,YANG Ting,CHEN Jie,SUN Wu-qing.Lipopolysaccharide exposure during gestation activates microglia to induce autism-like behavior in offspring of rats[J].Acta Horticulturae Sinica,2020,36(5):837-852.
Authors:FENG Di  CHEN Bao-lin  XIAO Lu  YANG Ting  CHEN Jie  SUN Wu-qing
Institution:Institute of Horticultural Biotechnology,Fujian Agriculture and Forestry University,Fuzhou 350002,China
Abstract:
Keywords:Lipopolysaccharides  Autism  Maternal immune activation  Microglia  Toll-like receptor 4  
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