| 大豆C2H2型锌指蛋白转录因子家族全基因组鉴定及表达分析 |
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| 引用本文： | 郭智滨,张亚坤,贺紫航,周强华,蔡占东,马启彬,年海.大豆C2H2型锌指蛋白转录因子家族全基因组鉴定及表达分析[J].大豆科学,2024(2):139-150. |
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| 作者姓名： | 郭智滨 张亚坤 贺紫航 周强华 蔡占东 马启彬 年海 |
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| 作者单位： | 1. 华南农业大学农学院/国家大豆改良中心广东分中心;2. 岭南现代农业科学与技术广东省实验室 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划“农业生物种质资源挖掘与创新利用”重点专项(2021YFD1201602)；;国家大豆产业技术体系建设项目(CARS-04-PS09)； |
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| 摘 要： | 为进一步寻找与大豆产量相关的潜在候选基因，利用生物信息学与转录组学技术，通过拟南芥(Arabidopsis thaliana L.)C2H2型锌指蛋白(C2H2 zinc finger protein)序列BLAST映射，将从大豆(Glycine max)的基因组数据库中筛选出的44个C2H2锌指蛋白家族成员分成11个亚家族，并对其进行系统进化、保守结构域、顺式作用元件、测序数据和转录组数据等相关分析。结果表明：C2H2锌指蛋白家族成员分布于17条大豆染色体中，且每个亚家族的基因结构域较为相近，呈高度保守性。成员启动子部分含有抗逆境胁迫以及激素相关的调控元件。RNA-seq结果显示，有8个基因在不同植物组织内表达差异显著。荧光定量PCR分析表明，3个基因的分析结果为SUPERMAN的转录调节因子，GmC1-1iZFP42为Ln位点的相应基因，参与大豆叶形和籽粒的调控，GmC1-1iZFP12、GmC1-1iZFP...
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| 关 键 词： | 大豆 C2H2 基因家族 表达分析 |
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