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PRRSV山东变异缺失株SX-1的全基因序列分子特征分析
引用本文:张金强,吴家强,石峰,孟斌,刘少宁,牛钟相.PRRSV山东变异缺失株SX-1的全基因序列分子特征分析[J].中国兽医学报,2011,31(3).
作者姓名:张金强  吴家强  石峰  孟斌  刘少宁  牛钟相
作者单位:1. 山东农业大学动物科技学院,山东泰安,271000;山东省农业科学院畜牧兽医研究所,山东济南,250100
2. 山东省农业科学院畜牧兽医研究所,山东济南,250100
3. 山东农业大学动物科技学院,山东泰安,271000
基金项目:山东省自然科学基金,山东省重大科技专项基金,山东省农科院青年基金
摘    要:对从山东某发病猪场采集的猪繁殖与呼吸综合征疑似病料中分离到的PRRSV病毒(SX-1株),应用RT-PCR方法分段扩增出PRRSV SX-1毒株的各基因片段,扩增后的产物分别克隆于pMD-18T载体鉴定后测序.序列号GQ875656.序列分析结果表明SX-1株基因组全长15 320nt(不包括poly尾),包含9个开放阅读框,5'UTR长189 nt,3'UTR长150 nt;SX-1株在分子遗传演化上属于PRRSV变异毒株,与参考毒株JXA1的核苷酸同源性为98.9%;与CH-1a和VR2332的同源性为94.8%和89.5%;而与LV的同源性仅为59.3%.基因系统发育树分析结果显示,SX-1与JXA1、GDBY1株的亲缘关系很近,与CH-1a亲缘关系较近,与VR2332、CC-1、RespPRRS/Repro MLV等毒株处于不同的分支.

关 键 词:PRRSV  分离  全基因组  序列与分析

Molecular characteristics of complete genome of a Shandong mutant strain of porcine reproductive and respiratory syndrome virus SX-1
ZHANG Jin-qiang,WU Jia-qiang,SHI Feng,MENG Bin,LIU Shao-ning,NIU Zhong-xiang.Molecular characteristics of complete genome of a Shandong mutant strain of porcine reproductive and respiratory syndrome virus SX-1[J].Chinese Journal of Veterinary Science,2011,31(3).
Authors:ZHANG Jin-qiang  WU Jia-qiang  SHI Feng  MENG Bin  LIU Shao-ning  NIU Zhong-xiang
Abstract:
Keywords:
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