长×巴F2代杂交猪黑素皮质激素受体Ⅰ基因克隆与多态性分析

【目的】探讨猪黑素皮质激素受体Ⅰ基因（MC1R）碱基突变与其毛色分离的相关性，为研究猪的毛色遗传分子机制及遗传育种奠定基础。【方法】根据GenBank已公布的猪MC1R基因同源序列（AF326520）设计引物，以70头不同毛色的长白猪×巴马小型猪杂交F2代（长×巴F2代）猪血液总DNA为模板，PCR扩增MC1R基因序列，并利用PCR-SSCP对长×巴F2代杂交猪的MC1R基因进行单核苷酸多态性（SNP）分析。【结果】长×巴F2代杂交猪MC1R基因编码区序列约963 bp，与参考序列（AF326520）的同源性为99.37%，共有6处碱基发生突变，其中两处（284G→A和306T→C）为错义突变，284G→A导致95Val→Met，306T→C导致102Leu→Pro；其余4处均为同义突变，分别为6C→T、51G→A、364T→C和730G→A。 PCR-SSCP检测结果显示，长×巴F2代杂交猪的MC1R基因均未表现出多态性。【结论】长×巴F2杂交猪的MC1R基因存在碱基突变，其基因型为ED1，但在不同毛色的长×巴F2代杂交猪群体中并未发现MC1R基因呈多态性，即猪毛色多样性不能简单以MC1R基因的多态性进行分析。