| 毛竹PhcircRNA1的鉴定和调控通路分析 |
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| 引用本文： | 陈玉静,丁一倩,周明兵.毛竹PhcircRNA1的鉴定和调控通路分析[J].核农学报,2023,37(4):680-689. |
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| 作者姓名： | 陈玉静 丁一倩 周明兵 |
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| 作者单位： | 浙江农林大学，省部共建亚热带森林培育国家重点实验室，竹子研究院，浙江 杭州 311300 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31870656);浙江自然科学基金重点项目(LZ19C160001) |
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| 摘 要： | 环状RNA(circRNAs)是一类经过反向剪切后，3′末端和5′末端共价结合形成的闭合环状单链非编码RNA，在环境胁迫下对植物生长发育有着重要调控作用。为探索circRNA在毛竹响应胁迫过程中的调控作用，本研究构建了circRNA-miRNA-mRNA调控通路。在分析毛竹的全转录组测序数据后，选择并鉴定了1个在紫外线胁迫（UV）和高温胁迫（42℃）下均差异表达的circRNA(PhcircRNA1)，并利用生物信息学分析其调控的miRNA和靶基因。通过核糖核酸酶R(RNase R)法鉴定其转录的稳定性，并通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)方法分析了PhcircRNA1、靶miRNA(Ph-miR156)和靶mRNA的表达特征。本研究进一步选择GLR3.1(Glutamate Receptor–Like Gene 3.1)靶基因作为研究对象，观察毛竹水培苗根尖生长至1 cm后的circRNA-miRNA-mRNA表达调控趋势。结果表明，在UV胁迫和高温胁迫下，PhcircRNA1和靶mRNA表达量都有明显下降趋势，而miRNA表达量增高。在毛竹根尖细胞中，PhcircRNA1和G...
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| 关 键 词： | PhcircRNA1 miRNA GLR3. 1(Glutamate Receptor-Like Gene 3. 1) 毛竹根尖 |
| 收稿时间： | 2022-06-08 |
Identification and Regulatory Pathway Analysis of PhcircRNA1 in Phyllostachys edulis |
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| CHEN Yujing,DING Yiqian,ZHOU Mingbing.Identification and Regulatory Pathway Analysis of PhcircRNA1 in Phyllostachys edulis[J].Acta Agriculturae Nucleatae Sinica,2023,37(4):680-689. |
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| Authors: | CHEN Yujing DING Yiqian ZHOU Mingbing |
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| Institution: | Bamboo Industry Institute，State Key Laboratory of Subtropical Silviculture，Zhejiang A&F University，Hangzhou，Zhejiang 311300 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | PhcircRNA1 miRNA GLR3 1（Glutamate Receptor–Like Gene 3 1） root tip of moso bamboo |
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