育成期舍饲蓝狐结肠菌群多样性分析

旨在分析蓝狐结肠菌群的组成及其多样性,为蓝狐肠道菌群体外培养提供基础数据。随机选取6只健康育成期(3～4月龄)雌性舍饲蓝狐,采集结肠食糜后采用高通量测序技术对蓝狐结肠菌群结构进行分析。结果表明:6个样品共获得377 798条有效序列,平均为62 966条有效序列;共获得2 064个OTU,平均为307个OTU,归类于12菌门、180个菌属。在门分类水平上,以厚壁菌门(Fir-micutes,70.25%)、拟杆菌门(Bacteroidetes,22.36%)、变形菌门(Proteobacteria,5.69%)、放线菌门(Acti-nobacteria,1.13%)为主,4个菌门占所有细菌总数的99.43%。在属分类水平上,以乳杆菌属(Lactoba-cillus,28.50%)、巨单胞菌属(Megamonas,7.48%)、拟普雷沃菌属(Alloprevotella,7.41%)、Peptoclostridi-um(6.33%)、乳球菌属(Lactococcus,5.38%)、Dialiste (4.39%)、巨型球菌属(Megasphaera,3.53%)、De-sulfovibrio(2.97%)、拟杆菌属(Bacteroides,2.48%)、unidentified_Lachnospiraceae(2.38%)为主。结果表明,在饲养条件下,蓝狐结肠中具有相对复杂的菌群结构,且个体间存在较大差异,研究为课题组进一步揭示蓝狐结肠菌群功能以及探索蓝狐结肠菌群体外培养研究提供了基础数据。

Analysis of colonic microbiota diversity of blue fox(Alopex lagopus) in growing period