肉牛CAST基因5'UTR和3'UTR多态性分析 |
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引用本文: | 刘振山,刘桂芬,宋恩亮,刘晓牧,谭秀文,万发春.肉牛CAST基因5'UTR和3'UTR多态性分析[J].山东农业科学,2015(3):108-112. |
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作者姓名: | 刘振山 刘桂芬 宋恩亮 刘晓牧 谭秀文 万发春 |
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作者单位: | 山东省农业科学院畜牧兽医研究所/山东省畜禽疫病防治与繁育重点实验室 |
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基金项目: | “十二五”农村领域国家科技计划课题(2011BAD28B04-02);山东省农业良种工程项目(2013 LZ014);山东省农业科学院重大科技成果培育计划(2014CGPY07) |
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摘 要: | 钙蛋白酶抑制蛋白(Calpastatin,CAST)专一抑制钙蛋白酶(Calpain,CAPN)活性,参与调节牛肉的嫩化及肌内蛋白的水解,其编码基因是肉质性状的主要候选基因。本研究根据牛CAST基因5'UTR区(GenBank No.AY834771)和3'UTR区(Gen Bank No.DQ991097)序列设计两对引物,用PCR-SSCP方法对鲁西黄牛和渤海黑牛共305个样本进行了单核苷酸多态性分析。结果显示,CAST基因5'UTR和3'UTR区存在PCR-SSCP多态,在5'UTR区存在6437(C/T)、6477(G/A)和6614(G/T)3个SNP位点,表现为AA、AB、BB、BC和AD 5种基因型;在3'UTR区存在359(T/C)和366(A/G)2个SNP位点,表现为EE、EF、FF和EG 4种基因型。经检验表明,鲁西黄牛和渤海黑牛均处于非Hardy-Weinberg平衡状态;群体遗传多态性分析表明这两种牛的多态信息含量均为中度多态。
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关 键 词: | 鲁西黄牛 渤海黑牛 CAST基因 5’UTR 3’UTR 单核苷酸多态性 |
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